一套用于化学信息指纹创建和相似性搜索的命令行工具和python库。
chemfp的Python项目详细描述
chemfp是一组用于生成化学信息的命令行工具 指纹并通过Tanimoto相似度搜索这些指纹, 以及可用于构建新工具的python库。
这些算法是为密集的,100-10000位而设计的 小分子/药物中出现的指纹 化学家。Tanimoto搜索算法是用C语言实现的 性能和支持阈值和k-最近搜索。
指纹生成可以通过提取现有的方法来实现。 来自SD文件或使用现有化学的指纹数据 工具包。chemfp支持open babel中的python库, openeye和rdkit工具包。