色谱文件用途
cfutils的Python项目详细描述
cfutils
色谱文件实用程序
用于Sanger测序数据可视化、对齐、变异调用和修剪等。
演示
command to generate demo above
cfutils mut --query ./data/B5-M13R_B07.ab1 --subject ./data/ref.fa --outdir ./data/ --plot
如何安装?
形式Pypi
(如果您不知道发生了什么,请仅使用这种方式)
pip install cfutils
操作源代码
从github克隆
git clone git@github.com:yech1990/cfutils.git
安装依赖项
make init
进行单元测试
make test
如何使用?
在命令行中
cfutils mut --help
作为python模块
importcfutilsascf
更改日志
- 为pypi构建为python包
- 修复高亮度错误基的错误
待办事项
- []通过比对和绘制色谱图调用突变
- []添加文档
- [X]通过峰值位置< /LI>改变x轴
- []修复修剪后色谱图开关位置的错误
- [X]作为cli应用程序包装
- []返回输出中的质量分数
- []修复选定基不在中间的问题
- []修复绘图色谱仪呈现错误