分析二维医学图像时间序列中区域变化的工具。

BMDanalyse的Python项目详细描述


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版权所有2016,michael hogg(michael.christopher.hogg@gmail.com

麻省理工学院许可证-有关使用和分发的详细信息,请参见license.txt

关于

用于对二维医学图像的时间序列进行区域分析的图形工具。这是为分析虚拟x射线而创建的,由计算机模拟结果的辅助工具bonemapypyvXRAY创建。预期用于评估随着时间的推移在多个感兴趣区域(roi)中的骨增益/损耗,通常是由于骨科植入物周围的应力屏蔽导致的骨重塑。

使用pyqt/pyside、pyqtgraph、numpy、matplotlib和枕头用纯python编写。应该可以在任何平台上工作,但只在windows上测试过。

要求

  • python 2.7版
  • Pyqt=4.11
  • PyqtGraph=0.9.10
  • numpy>;=1.9
  • matplotlib>;=1.4
  • 枕头=3.0

注意:所有这些要求都可以在anaconda python发行版中获得

使用说明

  • 加载二维医学图像的时间序列(图像格式,如bmp、png等)。所有图像应为灰度,大小相同。
  • 使用图像工具箱中的上/下箭头按时间顺序放置图像。SampleMedicalImages目录中提供了虚拟X射线的时间序列。
  • 创建一些感兴趣的区域(roi)并从分析工具箱中运行roi分析工具。将生成一个图,显示每个ROI随时间变化的平均灰度值。
  • 从分析工具箱中运行图像分析工具。将显示轮廓,以蓝色显示骨丢失区域,以红色显示骨增加区域。

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