计算分子生物学综合图书馆
biotite的Python项目详细描述
黑云母包将计算生物学中流行的工具捆绑到 统一框架。它提供文件I/O操作、分析和操作 用于生物序列和结构数据。此外,该软件包还提供了 流行的生物数据库和外部软件的接口。
内部结构和序列表示基于numpyndarrays,利用c加速操作的优势。费时的 无法矢量化的操作主要在中的cython中实现。 在这些地方也能达到C加速。
此外,该包还旨在实现简单的可用性和可扩展性: 表示结构和序列的对象可以像 一个数组。即使是真正的内部ndarrays也很容易访问 允许高级用户在现有的基础上实现他们自己的算法 类型。