benchlingapi 1.0

说明
==


benchling提供了一种方便的方式来存储整个实验室的dna序列（质粒、引物、pcr片段等）。此repo为提出benchling api请求提供了一个方便的包装器。


原始：html

<；ul>；

…raw：：html

<；li>；

原始：html

<；/li>；

…原始：html

<；li>；

原始：html

<；/li>；

…raw：：html

<；li>；


使用正则表达式搜索序列和文件夹

…原始：html

<；/li>；

…raw：：html

<；li>；

原始：html

<；/li>；

…raw：：html

<；li>；

原始：html

<；/li>；

…raw：：html

<；ul>；


安装
==

：


cd目录/that/contains/benchling api
pip安装。

用法
==


初始化api对象n用于访问benchling
序列的接口。它需要一个benchling api密钥，可以从
benchling请求该密钥。有关benchling API的更多信息，请访问这里：
https://api.benchling.com/docs/

：


rgument是benchling api密钥，可以通过benchling请求
，并通过滚动到您帐户的底部来访问
benchling上的信息。

find
^^^^^^


getting folders

。代码：：json

{'count'：59，'创建位置'：'2013-10-01t20:07:18+00:00，'描述'：''，'id'：'lib'pp6d50rjn1，'修改位置'：'2017-01-20t21:57:55.991758+00:00，'名称'：'plastids，'所有者'：'ent'a7blnccjtu，'权限'：{'admin'：true，'可追加'：true，'所有者'：false，'可读"：true，'可写'：true，'可写'：true，'可写'：true}，'序列'：[{'id'：'seq'whaiaxdfm''name'：'pgpt4-pgal1-pgal1-g（m）avny'，'文件夹'：'libpupp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'wq0wqqb9f'，'name'：'pmodu6-pgalz4-pgalz4-iaah'，'文件夹'：'libpupp6d50rjn1'}，{'id'：'id'：'seq'seq'seq'okitcpyx''''''''name''name'''''name'''''：'文件夹'：'库pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'wwwu3xwuzuu'，'name'：'pmodt4-pgalz4-pgalz4-avny'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'k5hwwwwwwg'，'name'：'pmodu6-pgal1-bleomx'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'ayq7toin'，'name'：'pbr3222（示例序列）'，'folder'：'lib'lib-pp6d50rjn1'}，{'id''，{'id''：'id'''：'id'''"Rb"，"name"："pgpt4-pgal1-egfp"，'文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id''id'：'seq'w5bmpzckn'，'姓名'：'pmodu6-pgalz4-natmx-pgalz4-natmx'，'文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'n2nxzz'，'姓名'：'pmodu6-pgalz4-far1-mut-87aa'，'文件夹'：'lib'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'id'：'seq'seq'w0fmhfmfzje'，'姓名'，'姓名'''：'pmodt4-pgalz4 gavny，'文件夹'：'库pp6d50rjn1'}，{'id'："Seq'U M42Pvreq'，'name'：'pmodt4-pgalz4-z4avny'pmodt4-pgalz4-z4avny'，'folder'：'lib'lib'id'：'seq'mfmww58ddd'，'name'：'libpl5g-pgalz4-ural4-ura3'，'folder'：'lib'ipp6d50rjn1'，'id'：'seq'id'：'seq'qqtekjjjjds'，'name'：'pgpt4-pgal1-pgal1-gavny'gavny mutated'library'library'，'folder'，'folder'：'lib：'seq_usnk27s'，'name'：'pmodu6 pgal"bleumz4-bleumx"，文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq-i0yl6uzk'，'名称'：'pmodh8-pgpd-tir1-dm'，'文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'pmodh8-pgpd-tir1-dm'，'文件夹'：'lib-pp6d50rjltvz'，'名称'：'pmodu6-pgal1-p1g1-hygmx'，'文件夹'：'lib'lib-pp6d50rjn1'}，{'id''id'：'seq'seq'seq'seq'seq-2r-2mx，'文件夹'：'库pp6d50rjn1'}，{'id'："seq_5axmlsvb"，"name"："pymod2kmx_pgal1-hyg_pgal1-iaah"，"folder"："lib_pp6d50rjn1"}，{"id"："seq_qihkmlw4"，"name"："pmodu6-pgal1-alfactor"，"folder"{'id'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq-k0muydim'，'name'：'pmodu6-pgal1-iaa17t2-far1-parl1''，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq-7yy7ep'，'name'：'pgp8g-tir1-y'，'folder'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq-guqgbxy'，'name'''name'：'pgpt4-pgpt4-pgal1-pgal1-gavny（vp64）新设计，'pgal1：'lib_pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq_fkfJZKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKKJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJ{'id'：'seq_sgfg2yeb'，'name'：'pmodU6-PGALZ4-PGALZU6-PGALZ4-GYGZU6-PGALZ4-PGALZ4-alphafafafafafafafafafafafafafafafafafafafafafafafafafofofofofofolder''libuva5d5dxrqdqd'，'folder''''lib'libpp6d5d50rjn6-pgalz4-pgalz4-pgalz4-hygramx'，'folder'''fofofofolder''''libuppp6d50rj6d50rjn1'}}，{'id''id''id'''''''id'''''''''''''''''pgph8-pgal1-gavny'，'文件夹'：'库pp6d50RJn1}，{'id'：'seq rwdordd9q，'姓名'：'pmodu6-pgalz4-far4-far1'，'文件夹'：'lib'upp6d50rjn1'}，{'id'：'seq ri07unts'，'姓名'：'pmodu6 pgpd eyfpp'，'文件夹'：'lib'pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq tstm0b8q'，'姓名'：'pmod4-pgal1z3（p3-pgal1z3-mf（p3）mf（al'，'文件夹'：'lib'lib'upp6d50rjn11''}，''''lib'lib，{'id'：'seq_qgfqobtp'，'name'：'pgpt4页"AL1-AVNY"，文件夹"：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'seq'9ph0snfnjv'，'name'：'ampr-t4-pgal1-gal4dbd-l1'，'文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'f4tecxu'，'name''：'pmodu6-pgalz4-spalz4-ste5-（-）ring'，'文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'id'：'seq'seq'seq'igdjeex4'igdjeeex4'，'name'''''1-p1g1-gev'，'文件夹'：'库pp6d50rjn1'}{'id'：'seq-hhi5ttbo'，'name'：'pmodu6-pgal1-far1-iaa17t21-iaa17t21-far17t21-far17t21-far17t21'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq-agq1w9ak'，'name'：'plab2'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id''：'pmodkan-ho-pact1gev'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1''''''''''''lib'lib-pp6ppp6d50rj1aD1IADKMZ，"名称"："PGPL5G-PGAL1-URA3"，"文件夹编者'：'lib'upp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'ettsaffd4'，'name'：'pgpu6-pgalz4-eyfp4'yfpp'，'folder'：'lib'upp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'5hcrwki8'，'name'：'pmodu6-pgalz4-p1g1-hygmx'，'folder'：'lib'lib'up6d50rjn1'}，{'id'：'seq'qc6f2kii'，'name''''''：'pmod4g-pmod4g-nls'pmod4g'pmod4g-nls'pmod4g'pl"，"文件夹"："lib_pp6d50rjn1'}，{'id'："seq_vazadbjw'，'name'：'pgpt4-pgal1-pgal1-gavny'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq-ztl4dnow'，'name'：'plab11'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'seq-kkktpz1rs'，'name'：'pmodt4-pgal1-p1g1-gavny'，'folder'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'id'：'seq'seq-4cu4cbmi1j'，'name'''name'''''''''：'pgpu6-pg-afb2，'文件夹'：'库pp6d50rjn1'}，{'ID'：'seq'tfgiil0c'，'name'：'pmodu6-pgal1-far1-pgal1-far1'，'folder'：'lib'libp6d50rjn1'}，{'id'：'seq 7o7ththysi'，'name'：'pmodu6-pgalz4-z4avny'，'folder'：'libp6d50rjn1'}，{'id'：'seq'w2izpfzd'，'name'：'pmodok-pact1-gavny'，'folder''：'libp6d50rjn1''''lib'lib pp6d50rjn1'}，{'id'：'id'：'"名称"："PMODU6-PGAL1-HYGMX"文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id''id'：'seq-nv6wyspv'，'name'：'far1-mut-87aa-87aa-tp'，'文件夹'：'lib-pp6d50rjn1'}，{'id'：'far1-mut-87aa-87aa-tp'，'文件夹'，{'id''id'：'pgp5g-ccdb'，'文件夹'：'lib-rzqqqqb2b2b2'，'name'：'pmodt4-pgal4-pgal4-pgal1-attb1-gvvvnvvvvvvvvvvvvvvv6wwwwwwwwwrjn1'}，{'id'：'序列l5vhtc8z，'名称'："pgpu6-pgal1-tir1-dm-pgpu6-pgpu6-pgal1-pgal1-tir1-dm，'文件夹'：'lib-pp6d5vn5fdpp'，'名称'：'pmodok-pact1-gavn'，{'id''id''id'''pmodok-pact1-gavn'，'文件夹'：'pmodok-pact1-gavn'，'文件夹'：'pmod2mffshfl'，'名称'：'pymod2kmx'pymod2kmx-pgal1-hyg-hyg-zev4-盒式录音带'，'文件夹'：'lib-ppppp6d50rjn1'}，{'id'，{'id'''id''名称'：'pmodu6-pgal1-far1-l1-iaa17t1''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''','''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''quence('CRY2', query ='name', regex =True)

e.固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固固sequesequesequesequesequesequesequesequesequesequesequesequesequesequesequesequesesequesequesequesequeseque-----------------------------------zrb'，query='id'，regex=false）

例如，查找名称中包含单词"cry2"的所有文件夹

：


benchlingapi.findfo文件夹（'cry2'，query='name'，regex=true）

quenceFromShareLink（'共享链接'）

r/>"序列名"，"名称"
"aggggggtctagctgatcgttatcgtgtgcgcga"，"基值"
"真"，"循环"或"不循环"
"库0g4t1fvv"，"文件夹"id
"描述="序列描述"，
"注释=[]，"注释当前在benchling中不受支持s api
）



例如创建文件夹

：：


benchlingapi.createFolder（'文件夹名'，说明='文件夹说明'，'所有者'='项目名称'）


删除
^^^^^^^^

例如删除文件夹

：


benchlingapi.deleteFolder（文件夹_






：
：




>benchlingapi.deleteSequence（文件夹id）



>编辑
^ ^ ^ ^ ^ ^

>例如编辑文件夹


：
：






















benchlingapi.patchsequence（name=none，base=none，circular=none，
folder=none，description=none，color=none）

benchlingportal
----

标签：

• name
• 文件夹
• 框架
• api
• id
• lib
• seq
• 直观
• benchling

欢迎加入QQ群-->： 979659372

推荐PyPI第三方库

• azuremldataprep

  防止攻击的包

• tnetwork

  时态网络图书馆

• inStrain

  应变水平量度的计算

• idiosync

  同步用户数据库

• persistingtheor

  防止攻击的包

• topsis-jaskeerat

  此软件包允许您在数据集上运行topsis，以进行多属性决策（MADM）

• buildsecurity-sdk

  在此处键入您的描述

• distributions-robinlamb-test

  高斯分布

• sparse-pendulum

  开放AI健身房摆锤环境与稀疏奖励

• gs-distributions

  高斯分布

• img-merge

  未提供项目说明

• festin

  Festin是一个强大的S3桶查找和内容发现

• alpaca-trade-api-fixed

  Python客户端API Alpaca

• djangocelerybeatstatus

  防止攻击的包

• sphinxautodocannotation

  防止攻击的包