分子动力学模拟中的分子追踪
aquaduct的Python项目详细描述
水管
aqua duct一种便于分析溶剂流动的新工具 分子动力学模拟中的分子。
请访问我们的主页aquaduct.pl。
概述
aqua duct包含几个构建在aquaductpython模块之上的应用程序：
- valve-执行大多数核心计算，包括分子追踪。
- kraken-对结果执行附加分析。
- pond-计算口袋、热点和能量分布。
aqua duct还带有简单的gui界面-valveconfig-允许以方便的方式设置计算。
可用性
aqua duct的许可
GNU GPL v3 license <https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.en.html>。
源代码位于github.com/TUNNELING-GROUP/aqua-duct。
我们的changelog中提供了最重要更改的摘要。
安装
aqua duct可以通过pypi轻松安装：
pip install aquaduct
有关aqua duct安装的详细说明，请访问 aquaduct.pl/installation。
要开始使用浅绿色管道，请键入：
valve.py --help
故障排除
如果在安装过程中遇到任何问题，请毫不犹豫 请在info@aquaduct.pl联系我们。我们非常愿意帮忙！
您也可以通过github.com/TUNNELING-GROUP/aqua-duct联系我们。
文档
文档可以在我们的主页aquaduct.pl/documentation上找到。
最新的文档也可以在TUNNELING-GROUP.github.io/aqua-duct找到。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
