ACQ4的自动小区配线扩展
acq4-autopatch的Python项目详细描述
ACQ4自动匹配
ACQ4的自动小区配线扩展
安装
使用例如将软件包安装到您的环境中
pip install acq4_autopatch
或者
^{pr2}$自定义以下内容以适合您的硬件，并将其添加到ACQ4的default.cfg部分
文件：
Autopatch:module:'acq4_autopatch.module.AutopatchModule'config:imagingDevice:'Camera'patchDevices:PatchPipette1:(0, 0)# bottom-left quadPatchPipette2:(50*mm, 0)# bottom-right quadPatchPipette3:(0, 50*mm)# top-left quadPatchPipette4:(50*mm, 50*mm)# top-right quadplateCenter:(0, 0, 0)wellPositions:[(0,0),(50*mm,0),(0,50*mm),(50*mm,50*mm)]safeMove:TruepatchStates:cell detect:maxAdvanceDistancePastTarget:1*umseal:autoSealTimeout:60pressureMode:'auto'cell attached:autoBreakInDelay:5.0clean:approachHeight:3*mmcleanSequence:[(-35e3,1.0),(65e3,1.5)]*5rinseSequence:[(-35e3,3.0),(65e3,15.0)]
使用
简要说明：
- 确保DataManager模块中有活动存储目录。在
- 打开摄像头模块。
- 第一次通过时，用这个把每个移液管移到原位，清洁和冲洗位置。在
- 在主ACQ4管理器窗口中，保存每个操纵器的主视图。在
- 在主ACQ4管理器窗口中，保存每个PatchPicket上的清洁和冲洗。在
- 进行任何其他必要的校准。在
- 对于每个移液管，打开单独的TaskRunner模块。
- 启用与该移液管相关的夹钳。在
- 配置修补单元后要执行的任务。在
- 打开MultiPatch模块。这对监控很有用。在
- 打开Autopatch模块。
- 按“添加点”并在相机中为每个要修补的单元格添加一个。对每口井重复上述步骤。在
- 选择你的采集协议。在
- 按“开始”
- 在“移液管”窗格或MultiPatch窗口中监视状态。在
- 通读结果或在“结果”窗格中查看错误。在
TODO创建然后链接到视频解释。在
许可
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