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Python refgene
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最新问答
所以我有一个从文件(查询)读取的字符串列表。我想将以“>;”开头的所有行附加到名为name\u list的列表中,并将其后面(但在下一行“>;”之前)的所有字母字符附加到列表中。这与我之前 ...
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我有一个字符串的格式是:
name = '>n263590 | AK138667 | mRNAlike lncRNA |'
所以当我想对它进行分区时,我使用了字符串:
^{pr2}$
我尝试 ...
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有人能帮我解决一个AWK问题吗?
我有一个大的GTF文件如下。第9个字段包含我要使用的gene iu id。在
文件1.gtf
chr1 hg38_refGene exon 67 ...
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假设我有一个列表,其中一些元素只有一个“=”,其他元素有很多:
l1 = [
'Gene.ensGene=ENSG00000111058',
'Gene.refGene=IL2,IL2 ...
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我需要帮助。我试着没有用。
如果file1的column2与file2的column1相同,那么$9 file1>;=$4文件2&&$10文件1<;=$五,
文件1
BG ...
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最新项目
文档的呈现版本位于:http://pythonhosted.org/cruzdb/
一篇描述cruzdb的论文发表在生物信息学上:http://bioinformatics.oxfordjournal ...
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refgene parser<;h3 align=“center”>;安装<;h3>;>克隆respository,然后在本地安装:``` bash$git clone htt ...
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