OSError:[Errno 36] Popen使用时文件名过长 - Python当我开始问上一个问题时,我正在使用python的tarfile模块提取tarball。我不想把提取的文件写在磁盘上,而是直接通过管道传输到另一个程序,特别是bgzip。在 #!/usr/bin/env ...2024-05-29 已阅读: n次
重用Luigi中的通用任务我很难理解如何在Luigi中创建可重用的任务,然后在具体情况下使用它们。在 例如。我有两个通用任务,对文件执行某些操作,然后输出结果: class GffFilter(luigi.Task): ...2024-05-29 已阅读: n次
如何从Python中使用管道tar.extractall我使用python的tarfile模块提取tarball。我不想把提取的文件写在磁盘上,而是直接通过管道传输到另一个程序,特别是bgzip。我也在尝试使用StringIO来解决这个问题,但是我甚至在那 ...2024-05-29 已阅读: n次
pytabix此模块允许快速随机访问用bgzip和 由tabix索引。它包含一个c扩展名,代码来自klib。BGZIP Tabix程序可用here。 安装 pip install --user pytabix ...2024-05-29 已阅读: n次
vcfremapperVCFRemapper 在不同基因组之间转换vcf文件中变体坐标的实用程序 建立。 安装 通过PIP安装: pip install vcfremapper 使用量 vcfremapper PATH_ ...2024-05-29 已阅读: n次