如何使用python加速最近邻搜索?我有一个代码,它计算最近的体素(未指定)到一个体素(已指定)。也就是说,我有一个体素数组,很少有体素已经指定了标量(1,2,3,4…等等)值,而且很少体素是空的(假设值是'0')。下面的代码查找与未指 ...2024-04-27 已阅读: n次
如何在numpy中以与Java相同的速度用函数值填充3D数组?我尝试用以下代码对3D圆柱体的体素进行建模: import math import numpy as np R0 = 500 hz = 1 x = np.arange(-1000, 1000, 1 ...2024-04-27 已阅读: n次
如何在open3d python中将体素网格转换为点云?我有一个来自雕刻的体素网格数据类型。现在,我想把这个体素网格转换成点云。这背后的主要原因是我需要从体素网格体积中获取网格 可能吗 到目前为止,我发现体素网格的get_voxels()方法返回所有体素。 ...2024-04-27 已阅读: n次
导致IOError的原因:错误的消息长度我使用python脚本从4D图像(功能性MRI扫描)中操作和提取信息。部分分析设置为使用多处理软件包并行运行(针对每个主题): pool = Pool(processes=numberCores) r ...2024-04-27 已阅读: n次
如何在Python中对三维标量场的等值面进行体素化?简而言之,我感兴趣的是使用Python对嵌入在3D中的2D对象进行体素化。最后,我想处理体素化数据,比如它们的坐标。一路上,我最终使用了VTK,但他们的小文档让我很反感。我能够对曲面进行体素化,但无法 ...2024-04-27 已阅读: n次
如何缩放图像使其各向同性?我有一个由72个z平面组成的堆栈,比如说,x轴700像素,y轴1000像素。 这是一个标签图像,意味着所有已分割的对象都由一个整数值定义,该整数值用作定义图像中对象占用哪些像素的标签。体素是各向异性的 ...2024-04-27 已阅读: n次
高效计算点云的体素索引假设我有一个输入点云X,由一个维度数组N x 3表示。此数组中的每一行对应于XYZ空间中的一个点,介于-1和1之间。现在,让k成为定义体素网格分辨率的参数(例如k=3对应于维度3 x 3 x 3的体素 ...2024-04-27 已阅读: n次
字典关键字:valu值在键:值对列一张单子?我正试图找到一种有效解析大型XML文件的方法。一般格式为: <things> <parameters> <various ...2024-04-27 已阅读: n次
插值/调整3D数组我有一个3D阵列,里面有来自mri数据集的体素。模型可以沿着一个或多个方向拉伸。E、 g.体素大小(x,y,z)可以是0.5x 0.5x2 mm。现在我想重新采样的三维数组成一个数组持有1,1,1毫米 ...2024-04-27 已阅读: n次
如何用体素填充三维图形?我试图用体素填充一个四面体来生成3D数据。我已经能够使用4个不同的点来生成四面体。我不确定如何使用NumPy或任何其他Python框架用体素填充四面体内部的区域。以下是生成四面体3D绘图的代码: # ...2024-04-27 已阅读: n次
如何实现三维数据的连接组件标签?在搜索/读取时,我找到了connected component labelling (2 Pass algorithm),它用于二维数据集。我必须为3d(体素)数据集实现连接组件标签。在2d连接组件标 ...2024-04-27 已阅读: n次
值错误:NumPy布尔数组索引分配无法将0个输入值分配给掩码为tru的N个输出值我有一个Dicom文件,我想在体素中应用一些具有不同操作的遮罩。但是,我想保留初始数组中的位置,因为我想重建图像。这就是我所做的: #The dicom data a=dicomm_data. ...2024-04-27 已阅读: n次
pyointsp点 pyoints是一个python包,用于方便地处理和分析点 云数据、体素和光栅图像。它是用来支撑 地理数据处理高级算法的发展。 一般概念 pyoints的关键思想是提供统一的数据结构来处理 以 ...2024-04-27 已阅读: n次
popeye在这里写一个更长的描述。 许可证信息 Popeye根据新的BSD许可的条款获得许可。查看文件 “许可证”了解此软件的历史记录、条款和条件 以供使用,并免责声明所有保证。 此处提及的所有商标均为其各自 ...2024-04-27 已阅读: n次
pyntcloud pyntcloud是一个python3库,用于利用python科学堆栈的强大功能处理3d点云。 Examples(我们鼓励您在不启动安装的情况下尝试示例Binder。) Documentati ...2024-04-27 已阅读: n次
quantiphyse-svQuantiphyse的超级体素插件 此插件提供用于量化的超体素聚类方法 必须安装Quantiphyse。要从pypi安装插件,请使用: pip install quantiphyse-sv 该插件 ...2024-04-27 已阅读: n次
kimimaro Kimimaro:骨架化密集标记图像 使用teasar导出的方法快速骨架化二维和三维numpy阵列中的所有非零标签。返回的骨架列表的格式为云卷 在3.7GHz英特尔i7处理器上,此软件包在一分钟内处 ...2024-04-27 已阅读: n次
voxel 体素 体素 自由软件:麻省理工学院许可证 文档:https://tartavull.github.io/voxel 功能 待办事项 历史记录 0.1.0(2016-09-17) ...2024-04-27 已阅读: n次
dijkstra3d dijkstra3d Dijkstra的最短路径变体,用于26个连接的三维图像卷或8个连接的二维图像。 在三维图像网格上执行dijkstra的最短路径算法。顶点是体素,边是26个最近的邻居(除了图像 ...2024-04-27 已阅读: n次
dicom-contour 将dicom图像和轮廓转换成numpy阵列的库。一种自动提取图像和遮盖体素的方法。 此包Python名称:dicom-contour 目前版本: d ...2024-04-27 已阅读: n次
pyVoxelStats 用于神经图像分析的体素统计工具箱的python实现 此包Python名称:pyVoxelStats 目前版本: pyVoxelStats 0.1.1 ...2024-04-27 已阅读: n次