DRF序列化多个模型我无法序列化多个对象as this answers says to do。特别是当试图在序列化程序GeneralSerializer上获取字段Functional的值时,它给出了这个错误“Got At ...2024-04-26 已阅读: n次
从.docx文档的xml中提取数据我需要提取标签之间的数据,如下所述。另外,如果数据对应于相同的id,我想连接数据 例如,根据下面的XML,两个标记都位于对应于相同id“00F1234A”的选项卡内 因此,需要提取“Hello Wor ...2024-04-26 已阅读: n次
SQLAlchemy过滤器我试图对sqlalchemy中的查询执行一个简单的筛选操作,如下所示: q = session.query(Genotypes).filter(Genotypes.rsid.in_(inall)) ...2024-04-26 已阅读: n次
Pandas纪念馆我想合并两个数据帧使用pandas但是我得到了一个内存错误。这可能是一个内存问题,因为我的文件有大约40000000行(df1)和80000000行,有5列(df2a),但是,当我尝试将其他类似的文件 ...2024-04-26 已阅读: n次
从2个文件进行“大”数据csv搜索我有一个计算问题。你知道吗 我正在使用python迭代2个csv文件。你知道吗 csv file1=包含(6-7)列。。重要的一列是dbSNP中的一个“rsid”列。你知道吗 csv file2=3列 ...2024-04-26 已阅读: n次
按多个列对unique排序,然后合并非匹配列中的值考虑一个包含基因变异的bed文件: CHR START STOP RSID REF/ALT PHENOTYPE PVALUE 1 987654321 987654322 rs123456 A/T H ...2024-04-26 已阅读: n次
这个错误是什么意思?Python line = line.strip() rsid, chromosome, position, genotype = line.split(",") 它给了我一个值错误 ValueError: N ...2024-04-26 已阅读: n次
如何在Python中删除\n换行分隔符?我想比较23andme的一些基因组序列原始数据,并使用Python进行比较 我已按如下方式导入我的数据: import pandas as pd import os sample_1 = pd.re ...2024-04-26 已阅读: n次
我在一个tsv文件中有300000列,我只需要10000列。它们都以“rsid\u set(variable)”开头。我几乎没有编码经验,但一直在尝试使用R和python。有什么快速的方法可以得到我想要的那些专栏吗?你知道吗 追问:有没有办法取每列的平均值,把 ...2024-04-26 已阅读: n次
在python的list中添加sub-dictional元素我正在尝试在列表中添加子字典元素。这是给我的类型错误。 这是字典和我的代码: { "key1": "value1", "key2": { "skey1": "svalu ...2024-04-26 已阅读: n次
有没有一种方法可以在Python中解析CSV文件,在该方法中,字段可以包含回车字符?我有一些来自SAS数据集的数据,我们正在将其移植到一个基于web的系统。由于各种错误,我一直无法使用Panda的SAS或STATA导入,因此CSV似乎是最安全的选择,但是,由于它在某些字段中有返回字符 ...2024-04-26 已阅读: n次
pyhg19PYHG19 从变量的rsid中获取变量的坐标,或从变量的rsid中获取变量的坐标。 坐标 安装 首先,请确保遵循了 pydbsnp。然后安装pyhg19 使用pip3: pip3 install p ...2024-04-26 已阅读: n次
pydbsnpPYDBSNP 与DBSNP VCF数据接口 安装 step 0(可选):如果不想使用环境变量 不要在意pydbsnp在引擎盖下是如何工作的,跳过这一步。 如果愿意,可以确定pydbsnp查找相关内容 ...2024-04-26 已阅读: n次
myvariant 简介 MyVariant.Info提供简单易用的REST web服务来查询/检索genetic 变量注释数据它的设计简单,注重性能。 myvariant是一个易于使用的python包装器,用于 ...2024-04-26 已阅读: n次