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Python sapiens
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最新问答
我试图将我的大数据帧打印到csv文件,但制表符分隔sep='\t'不起作用。然后我用newline sep='\n'进行测试,看起来工作正常,用newline打断所有元素。这里可能出了什么问题?
代码 ...
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如果蛋白质ID列在txt文件(Interested proteins.txt)中,我想从新文件(swissprot_canonical-isoforms.fasta)中的.fasta文件(swissp ...
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我正在寻找使用python优化大数据解析问题的性能。如果有人感兴趣:下面的数据是六种灵长类动物全基因组DNA序列比对的片段。在
目前,我知道如何处理这类问题的最好方法是打开我的每个~250(大小为20 ...
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例如,我需要两个方括号之间的所有内容。
文件1
[Home sapiens]
[Mus musculus 1]
[virus 1 [isolated from china]]
所以考虑到上面的例子, ...
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我想要一个脚本,可以从一个文件中提取所有fasta记录,其中包含头中的任何字符串列表
如果我在一个文件中有这样一个列表:
2.A.1.13.5
3.A.1.208.23
还有一个像这样的文件:
&g ...
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我有一个.json文件,有448条记录。文件的格式如下-
2条记录作为样本数据
{
"_id" : ObjectId("5a5faa4f8b91277fde0212b1"),
"geo ...
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我在为绘图指定自己的x和y值时遇到一些问题。
默认情况下,x和y是数据框列名的组合
例如,var_组合包含:
(('Cerebrum Volume', 'Cerebellum Volume'), (' ...
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我试图从一个有几千个序列的.txt文件中提取字符串,并用这些字符串编写一个CSV。我已经从原始的.txt文件中删除了所有不相关的信息,这是我现在拥有的文档的格式:
DEFINITION Homo s ...
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我试图从python调用unix sort命令来排序一个制表符分隔的文件,但我做不到。当我在google上搜索时,我发现在命令中添加-t$'\t'是有效的,当我试图从shell中进行排序时,我也为我工 ...
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我知道如何在两行之间解析,当开始的“目标词”和结束的“目标词”不同时
例如,如果我想在X和Y之间解析:
parse = False
for line in open(sys.argv[1]):
if ...
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我使用rsync递归到该目录中的所有文件(包括子目录中的所有文件):
rathi/20090209.02s1.1_sequence.txt
rathi/20090209.02s1.2_sequence ...
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我怎么能在一行写多行?我的输入如下:
HOXC11
HOXC11, HOX3H, MGC4906
human, Homo sapiens
HOXB6
HOXB6, HOX2, HU-2, HOX2 ...
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最新项目
DNA分析仪IBP
用于创建回文、p53和g-四链分析的工具。作为ibp dna分析器api bioinformatics.ibp的api包装。
当前正在使用dna分析器服务器的本地 ...
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