Python vmd_专题 - Python中文网

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关于vmd 相关联的Python项目和问题：

使用被引用模块的变量

在我的项目中，我定义了3个python文件： variables.py（其中包含一些变量，其值将由用户填写）： VMD_name = "DEV56" VD_IP = "96.119.86.29" ...

2024-04-27 已阅读: n次

xlXYScatter正在由Python生成时产生xlXYScatterLines。

我正在编写在excel中生成XY散点图的代码，但我似乎无法生成简单的XLXY散点图，相反，我的程序会生成XLXY散点线。在我正在使用win32com，并尝试使用枚举数（-4169）、win32com ...

2024-04-27 已阅读: n次

你能在Bash脚本或Python脚本中嵌入一个TCL脚本，它可以被外部程序调用吗？

我正在写一个脚本来提取一些关于我一直在运行的一系列化学模拟的有用数据。在为了得到这些数据，我需要（1）一个C程序，它从一个名为*.pdb的文件类型计算密度。我已经有了。（2）我需要使用一个名为vmd ...

2024-04-27 已阅读: n次

在MAC上安装支持python的VMD

我一直试图在支持python的Macbook上安装VMD1.9.2，但一直未能成功。在我看来，VMD的打包的.dmg文件没有Python支持。我使用命令vmdinfo options来查找安装VMD的 ...

2024-04-27 已阅读: n次

当一个特定的模式在一个输入文件中出现几次时，如何将该模式后面的一系列行打印到单独的文件中

对不起，我之前的帖子，我不知道我在做什么。我试图在给定的输入文件中剪切出特定范围的行，并将该范围打印到一个单独的文件中。此输入文件如下所示： 18 generated by VMD C ...

2024-04-27 已阅读: n次

如何使用python3从大体积结构构建球形纳米颗粒

问题定义：我想构建半径为40埃（4nm）的磁赤铁矿纳米颗粒（γFe2O3）球形纳米颗粒。我有大批量系统的lammps数据文件（复制：101600000个原子）。我是python的初学者，但我已经成功地 ...

2024-04-27 已阅读: n次

有没有办法在windows上使用32位python 2.7从线程打开64位exe？

我有一个用32位python 2.7构建的tkinter UI，我制作了一个按钮，我最终希望在不中断UI的情况下打开外部应用程序（64位exe文件）。我的按钮启动一个线程，该线程反过来启动一个带有新控 ...

2024-04-27 已阅读: n次

Django初学者问题

我是web开发新手，刚刚拼凑出我的第一个django web应用程序，并使用mod\wsgi与apache集成。该应用程序有大约15个参数，您可以在这些参数上查询多个SQL server数据库，结果 ...

2024-04-27 已阅读: n次

数字和字母的正则表达式，而不仅仅是数字

我有一根绳子： S3UPLOAD:Uploading file: /var/mobile/Applications/999445D0-5B4D-4078-9B81-4F65D3474971/Docum ...

2024-04-27 已阅读: n次

如何使用python脚本输出.pdb文件？

{pda}当前正在操作python.m文件的pda}。我的最终目标是将python脚本转换回pdb文件，以便可以在VMD或PyMol.罐谁来帮忙？在 ...

2024-04-27 已阅读: n次

编写Python或TCL VMD脚本

有人知道一个完整的教程来学习编写Python吗还是TCL脚本？我想写一个脚本来装载一个分子，做3个表示，并改变每个属性（如着色方法、绘图方法、isovalue等），最终渲染图像。在我看过这个教 ...

2024-04-27 已阅读: n次

用python控制外部程序

对于我的研究，我需要处理大量的数据。数据需要通过一个名为VMD的程序进行分析，并最终存储在excel表格中。我的目标是自动化整个过程，而不是复制粘贴所有不同的文件我是python的完全初学者，并且刚 ...

2024-04-27 已阅读: n次

vmdp

变分模式分解python包计算信号变分模式分解的函数（Dragomiretskiy和Zosso，2014年）原始vmd纸张： Dragomiretskiy，K.和Zosso，D.（2014）“变分 ...

2024-04-27 已阅读: n次

simpletraj

基于[gromacs]（http://www.gromacs.org/）、[mdanalysis]（http://www.mdanalysis.org/）和[vmd]（http://www.ks.ui ...

2024-04-27 已阅读: n次

dynasor

dynasor是计算全部和部分动力结构因子以及电流分子动力学模拟中的相关函数。主要投入由MD模拟的轨迹输出组成，即包含对应的粒子坐标和可选速度的快照在（模拟）时间内连续、等间距的点。 dyn ...

2024-04-27 已阅读: n次

pdbParser

它是一个蛋白质数据库（.pdb）文件操作包，主要用于解析和加载、复制、操作和创建pdb文件。 pdb文件的完整描述可以在这里找到：http://deposit.rcsb.org/adit/docs/p ...

2024-04-27 已阅读: n次

colvars

#集合变量模块（colvars）实现了各种函数和算法，包括基于热力学力的自由能估计器，非平衡功和概率分布。[vmd]（http://www.ks.uiuc.edu/research/vmd/）。请检查 ...

2024-04-27 已阅读: n次

pymeshio

URL http://pypi.python.org/pypi/pymeshio/ https://github.com/o ...

2024-04-27 已阅读: n次

vmd2json

这使用xmlutils尝试帮助HL7到XML到JSON的转换 ...

2024-04-27 已阅读: n次

py-vmdetect

python虚拟机检测库 python虚拟机检测工具检测虚拟环境-vmware、xen、freebsd jail eg 自由软件：麻省理工学院许可证文档：https://py-vmdete ...

2024-04-27 已阅读: n次

vmd

终端降价渲染器此包Python名称：vmd 目前版本： vmd 0.1.1 最后维护时间：Jun 29, 2017 ...

2024-04-27 已阅读: n次