Python 特异性_专题 - Python中文网

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关于特异性相关联的Python项目和问题：

用Python法计算灵敏度和特异性

我想计算2个numpy数组的灵敏度和特异性（test，truth）。两个数组的形状相同，只存储数字0（test/truth false），1（test/truth true）。因此我必须计算假阳性，真 ...

2024-04-27 已阅读: n次

CNN超参数贝叶斯优化的自定义损失函数

我有一个不平衡数据（1:17比率）的二元分类问题。我想用有线电视新闻网进行分类。我想用贝叶斯优化优化学习率和卷积核数（过滤深度）。我的度量分数非常疯狂，我的意思是，高灵敏度通常具有较低的准确性和特异性 ...

2024-04-27 已阅读: n次

tf.keras.指标.灵敏度阈值说明

我正试着让我的头在tf.keras.metrics.SensitivityAtSpecificity左右。我对单独的敏感性和特异性的概念很好，但我不确定这两个概念在这个单一指标中是如何联系在一起的。你 ...

2024-04-27 已阅读: n次

二值分类中类不平衡的处理

以下是我的问题的简要描述：我在做一个有监督的学习任务来训练一个二元分类器。我有一个大类不平衡分布的数据集：8个负实例，每个正实例。我使用f-measure，即特异性和敏感性之间的调和平均值，来 ...

2024-04-27 已阅读: n次

如何绘制敏感性和特异性的ROC？

特异性=1-FPR 我修改了代码如下： plt.plot(1-fpr, tpr, 'b', label = 'AUC = %0.2f' % roc_auc) 但这个数字似乎是错的。这是我在报纸上 ...

2024-04-27 已阅读: n次

多个类别意味着ROC计算

让我们假设我有（为简单起见）3类对象检测器，我想绘制平均ROC曲线。我可以成功地为每个类绘制ROC，如下所示。你知道吗值是正确的，因此曲线是正确的。问题是我有（正如你在图上看到的）每个类不同的样本 ...

2024-04-27 已阅读: n次

sklearn：多类问题和报告的敏感性和特异性

我有一个三类问题，我能够用以下代码报告每个类的精度和召回率： from sklearn.metrics import classification_report print(classificatio ...

2024-04-27 已阅读: n次

在平衡验证集中，我们是否有可能具有很高的验证准确性和低的灵敏度和特异性？

我有个问题。我正在使用Keras和TensorFlow后端进行图像识别。有两类：积极任务和消极任务。你知道吗我使用的是一个预训练模型（带有冻结权重）和一个密集层（不是冻结）。你知道吗我报告了一个问 ...

2024-04-27 已阅读: n次

numpy.nanmean公司元素子集

我想获取元素的子集，并快速地将nanmean应用到关联的列，而无需循环。你知道吗对于特异性，请考虑还原数组r=[0,2,3]和数据数组 a=np.array([ [2,3, ...

2024-04-27 已阅读: n次

灵敏度-特异性曲线

我试图复制一个类似于这张图的敏感性-特异性图：其中X轴是阈值但是我还没有找到如何做到这一点，一些skalern指标，如ROC曲线返回真阳性和假阳性，但我没有找到任何选项，使这个图在那里。在我试 ...

2024-04-27 已阅读: n次

Python中不平衡类的欠采样

我目前拥有超过800000个数据点的不平衡数据集。这种不平衡是严重的，因为两个类中只有3719个数据点。在使用Python中的NearMiss算法对数据进行欠采样并应用随机森林分类器后，我能够获得以下 ...

2024-04-27 已阅读: n次

我如何在patsy中按组对变量进行降级？

对于回归，我想从（许多）右侧变量（它们是相互作用）中减去组特定的平均值。你知道吗没有群体特异性，这当然很容易。你知道吗 y, X = dmatrices('lhs ~ center(x1 * k1) ...

2024-04-27 已阅读: n次

SMART-BS-Seq

Smart的自述文件时间戳：<；2018-01-31 10:35:00 Liu Hongbo>； ...

2024-04-27 已阅读: n次

proteoclade

保护 ...

2024-04-27 已阅读: n次

triform2

提高芯片序列峰值发现的灵敏度、特异性和假发现率的控制。 ...

2024-04-27 已阅读: n次

emase

等位基因特异性表达的期望最大化算法 Narayanan Raghupathy、Kwangbom Choi、Steve Munger和Gary Churchill ...

2024-04-27 已阅读: n次

tcellmatch

tcellmatch：预测t细胞表位特异性。密码马上就到。 ...

2024-04-27 已阅读: n次

rpy2-bioconductor-extensions

rpy2.bioconductor-extensions proposes extensions to RPY2 for bioconductor/bioinformatics users ...

2024-04-27 已阅读: n次

mapGL

MAPGL H2>基于系统进化最大简约性的基因组序列元件的遗传增益和丢失预测将基因组区域标记为直系，在查询物种中获得，或在目标物种，基于最近共同祖先（mrca）。链接的路线文件用于映射查询目标 ...

2024-04-27 已阅读: n次

tspex

tspex Overview Documentation Installation Python API tutorial Command-line interface Examples 概述 t ...

2024-04-27 已阅读: n次

MFEprimer-linux

一个基于热力学的快速程序，用于检查PCR引物特异性（Linux特异性）有关详细信息，请参阅自述文件。 ...

2024-04-27 已阅读: n次

MAnorm

简介芯片seq被广泛用于描述转录因子和其他染色质相关蛋白。尽管芯片序列数据集的比较是理解单元的关键类型依赖性和细胞状态特异性结合，从而研究细胞特异性基因调控，很少有定量的方法发达的。 ...

2024-04-27 已阅读: n次

gbrs

====gbrs====…图片：：https://img.shields.io/pypi/v/gbrs.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/gbrs…图片：：htt ...

2024-04-27 已阅读: n次

hlaquant

Hlaquant 作者：Austin Crinklaw 这是什么？ hlaquant是一条为hla基因产生快速、准确等位基因特异性表达的管道。这是通过使用具有个性化序列的鲑鱼对肽结合沟域进行量化来完成 ...

2024-04-27 已阅读: n次

mutexp

mutexp：根据dna特征预测突变等位基因的表达 ...

2024-04-27 已阅读: n次

transplanttoolbox-victor

分子hla分型数据的虚拟交叉匹配说明通过交叉引用候选抗原实现实体器官移植的虚拟交叉匹配供者的hla分型。当供者的hla分型模棱两可而候选者有等位基因特异性抗体。Victor:分子类型数据的虚 ...

2024-04-27 已阅读: n次

zgeo.plone.atom

georss的plone特异性原子聚合此包Python名称：zgeo.plone.atom 目前版本： zgeo.plone.atom 0.2 ...

2024-04-27 已阅读: n次

ssrviz

摘要同源蛋白质可分为蛋白质家族。一个家庭的成员有相似的结构和顺序。尽管它们固有的相似性，但同一家族的个体成员可以采用非常特殊的功能，从而进一步划分为亚家族。这些功能上的差异通常可以分配给特定的残基。 ...

2024-04-27 已阅读: n次

pydnameth

比重 DNA甲基化分析包这个包提供了一些分析神话化数据的管道。主要目的是发现甲基化之间的相互关系，与年龄、性别、疾病等特征有关。免费访问甲基化数据集的示例： GSE4027 ...

2024-04-27 已阅读: n次

pepbox

邮箱==…raw：：html<；p>；t细胞激活导致针对病原体的产生性t细胞反应与其t细胞受体（tcr）特异性有关。tcr区分结构上与类似肽无关的能力定义了t细胞的特异性。关联驱动指定。与 ...

2024-04-27 已阅读: n次

codon-harmon

密码子和声基于物种特异性密码子使用分布的氨基酸反向翻译和dna优化工具。物种特定数据可以在Codon Usage Database上使用NCBI Taxonomy database ...

2024-04-27 已阅读: n次

troppo

troppo troppo（使用omics数据进行组织特异性重建和表型预测）是一个包含方法的python包。用于组织特定重建，与基于约束的模型一起使用。本包的主要目的是提供一个开源的框架，它既 ...

2024-04-27 已阅读: n次

Python 特异性

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