读取csv而不使用行枚举列,并使用自定义键进行排序我有一个TSV文件,我想读取它,按特定列排序并将其写回。 我遇到的两个问题是: 提供自定义键会导致错误(我将在文章末尾显示回溯) 在不提供自定义密钥的情况下,将完成排序。但是,当我将数据帧写回TSV ...2024-04-28 已阅读: n次
根据文件名列表打印目录中文件的某些行我试图打印基于正则表达式的目录中许多文件的特定行。我有一个文件名列表和一个包含这些文件的目录。我只知道如何打印目录中所有文件的行。但我只需要打印filename.txt列表中文件的行 for f in ...2024-04-28 已阅读: n次
按''>names'和'sequences'组织字符串列表。Python所以我有一个从文件(查询)读取的字符串列表。我想将以“>;”开头的所有行附加到名为name\u list的列表中,并将其后面(但在下一行“>;”之前)的所有字母字符附加到列表中。这与我之前 ...2024-04-28 已阅读: n次
Python脚本将序列添加到一起。不包括第一个元素?因为某些原因,它不包括第一个条目,我不知道为什么?当我使用第一个条目时,即 ">mm10_ensGene_ENSMUST00000038432 range=chr1:172956768-1729 ...2024-04-28 已阅读: n次
在Python中对字符串进行分区我有一个字符串的格式是: name = '>n263590 | AK138667 | mRNAlike lncRNA |' 所以当我想对它进行分区时,我使用了字符串: ^{pr2}$ 我尝试 ...2024-04-28 已阅读: n次
如何从文件中删除行并在R中输出修改后的文件?我有以下数据。这是一个大的.SAM文件的开头。我需要拆下24、25和;26并将输出写入与.SAM文件相同的文件。有什么简单的方法可以做到这一点吗 @HD VN:1.0 SO:unsorted ...2024-04-28 已阅读: n次
DeepGMA 简介 生物学的基本目标之一是基因型-表型映射,或者从基因型预测表型。基因型最初是指一组影响表型的蛋白质编码基因,但在这里我将基因型的定义扩展到决定表型的基因组序列,其中包括基因调控序列等非编码区域。 ...2024-04-28 已阅读: n次
regionanalysis***************区域分析********这是一个实用的注释基因组间隔,如芯片序列的峰值列表或基因组研究的其他间隔列表。现在它支持人类(hg19)、老鼠(mm9、mm10)和老鼠(rn4) ...2024-04-28 已阅读: n次
annot-utils不能使用 简介 annot_utils是一个生成tabix索引注释文件的软件,可以由y.s共享。 目前,该软件只支持hg19(grch37)、hg38(grch38)和mm10(grcm38)的 ...2024-04-28 已阅读: n次