python如何找到哪些父类定义子对象的方法在上下文中,我将使用提示这个问题的示例,即Scikit Bio的DNA序列类。在 基类是一个通用的python序列类。序列类从该类继承特定于核酸(DNA、RNA…)的序列。最后,还有一个从序列继承的D ...2024-04-30 已阅读: n次
更快的操作阅读fi我必须处理一个15MB的txt文件(核酸序列),并找到所有不同的子字符串(大小5)。例如: ABCDEF 返回2,因为我们有ABCDE和BCDEF,但是 AAAAAA 将返回1。我的代码: con ...2024-04-30 已阅读: n次
libnanolibnano是beta版的 核酸工具包 用于处理dna序列的低级python模块 它的开发目的是在特定于应用程序的库中用作COG,同时避免膨胀。<;br/>; 目标是要快,所以大 ...2024-04-30 已阅读: n次
barnaba 简介 barnaba是分析rna三维结构和模拟的工具。barnaba使用mdtraj来读/写拓扑和轨迹文件,因此它支持多种格式,包括pdb、xtc、trr、dcd、binpos、 ...2024-04-30 已阅读: n次
molber 分子信标由核酸外循环供电。 Molbery是一个基于python的工具,它从fasta序列中识别出29个探针,其中7个基在stem中,8个在loop中,7个在overhang中。这是基于左晓磊等人 ...2024-04-30 已阅读: n次
bio2bel-kegg这个包通过包装其restful api,允许用kegg信息丰富bel网络。 此外,它还集成在ComPath environment中,用于路径数据库比较。 安装 bio2bel_kegg可以通过Py ...2024-04-30 已阅读: n次
recinam“核酸记忆互易转换器”将任何文件转换为DNA序列,反之亦然。 >>> This package is developed to convert any type of file in ...2024-04-30 已阅读: n次
phigaro功率因数V 0.2.1.8 Phigaro是一个从核酸序列(包括亚基因组集合)预测和注释噬菌体和原噬菌体的命令行工具,它基于通过PVOG轮廓HMMS和平滑窗口算法识别噬菌体基因。https://doi ...2024-04-30 已阅读: n次