使用pandas,我需要返回每个groupby对象的最大计数行。
我有一个名为“matches”的数据框,它如下所示:
FeatureID gene pos
0 1_1_1 KRAS_1 6
1 1_1_1 KRAS_2 8
2 1_1_1 KRAS_3 11
3 1_1_1 NRAS_1 3
4 1_1_1 NRAS_2 11
5 1_1_1 NRAS_3 84
6 1_1_10 KRAS_1 4
7 1_1_10 KRAS_2 3
8 1_1_10 KRAS_3 14
9 1_1_10 NRAS_1 4
10 1_1_10 NRAS_2 6
11 1_1_10 NRAS_3 83
我需要按FeatureID将数据帧分组,然后获取每组中的位置计数:
matches.groupby(["FeatureID", "gene"]).count()
结果是:
FeatureID gene
1_1_1 KRAS_1 6
KRAS_2 8
KRAS_3 11
NRAS_1 3
NRAS_2 11
NRAS_3 84
1_1_10 KRAS_1 4
KRAS_2 3
KRAS_3 14
NRAS_1 4
NRAS_2 6
我需要返回每个groupby对象中包含最高计数的行,但我不知道如何做到这一点。
FeatureID gene count
1_1_1 NRAS_3 84
1_1_10 KRAS_3 14
下一行给出了每个groupby组的最大值的基因:
matches.groupby(["FeatureID", "gene"]).count().sort_values("pos").groupby(level=0).tail(1)
你可以在
level=0
上使用max
如果保持两个水平
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