我尝试在python中使用split来迭代列,但是当尝试访问列时,我得到一个错误,即某个特定的列表索引超出了范围。你知道吗
我的文件是这样的:
chr1 15585711 . A T 45.7081 . AB=0;ABP=0;AC=2;AF=1;AN=2;AO=3;CIGAR=1X;DP=3;DPB=3;DPRA=0;EPP=9.52472;EPPR=0;GTI=0;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;MQMR=0; NS=1;NUMALT=1;ODDS=8.76405;PAIRED=0;PAIREDR=0;PAO=0;PQA=0;PQR=0;PRO=0;QA=78;QR=0;RO=0;RPP=9.52472;RPPR=0;RUN=1;SAF=0;SAP=9.52472;SAR=3;SRF=0;SRP=0;SRR=0; TYPE=snp GT:DP:RO:QR:AO:QA:GL 1/1:3:0:0:3:78:-7.28,-0.90309,0
这是我的密码:
target = open('file', 'r')
for line in target:
line = line.split('\t')
print line[1]
当我打印行时,它看起来像一个列表,并且line[0]
访问chr1
,这是第一列。但当我尝试访问其他列时,我无法访问。你知道吗
源未使用选项卡。只需使用:
我刚刚用你提供的数据创建了一个文本文件,可以毫无问题地拆分它。我建议使用
with open
它将在完成后为您关闭文件:输出:
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