如何在python中更改glob模块的内部排序系统

Question

将regex应用于以'chr[0-9XY]'*开头的目录的名称文件后，我按以下顺序获得一个列表：

['chr9', 'chr8', 'chr7', 'chr6', 'chr5', 'chr4', 'chr3', 'chr2', 'chr1', 'chr10', 'chr11', 'chr12', 'chr13', 'chr14', 'chr15', 'chr16', 'chr17', 'chr18', 'chr19', 'chr20', 'chr21', 'chr22', 'chrX', 'chrY']

我申请了环球网模块来迭代目录中所需的文件，并按此方式排序。在

我的问题是，是否有可能使glob模块以不同的方式对文件进行排序，即按整数排序，最后是X和Y排序

['chr1', 'chr2', 'chr3', 'chr4', 'chr5', 'chr6', 'chr7', 'chr8', 'chr9', 'chr10', 'chr11', 'chr12', 'chr13', 'chr14', 'chr15', 'chr16', 'chr17', 'chr18', 'chr19', 'chr20', 'chr21', 'chr22', 'chrX', 'chrY']

有没有办法做到这一点？提前谢谢！在

Answer 1

您可以使用一个名为natsort的第三方库，它之所以这样称是因为它自然地对元素进行排序。

您可以通过pip install natsort安装它。您将需要pip，如果您还没有安装它，那么请查看here（如果您使用的是windows），否则，有不同的安装方法pip如果您的系统上尚未安装{}，简单地做一个简单的搜索，您会找到合适的指南。

完成后，您可以轻松使用natsort为您完成所有工作：

>>> import natsort
>>> var = ['chr9', 'chr8', 'chr7', 'chr6', 'chr5', 'chr4', 'chr3', 'chr2', 'chr1', 'chr10', 'chr11', 'chr12', 'chr13', 'chr14', 'chr15', 'chr16', 'chr17', 'chr18', 'chr19', 'chr20', 'chr21', 'chr22', 'chrX', 'chrY']
>>> natsort.natsorted(var)
['chr1', 'chr2', 'chr3', 'chr4', 'chr5', 'chr6', 'chr7', 'chr8', 'chr9', 'chr10', 'chr11', 'chr12', 'chr13', 'chr14', 'chr15', 'chr16', 'chr17', 'chr18', 'chr19', 'chr20', 'chr21', 'chr22', 'chrX', 'chrY']

Answer 2

使用以下代码对blob进行排序：

blobs = ['chr9', 'chr8', 'chr7', 'chr6', 'chr5', 'chr4', 'chr3', 'chr2', 'chr1', 'chr10', 'chr11', 'chr12', 'chr13', 'chr14', 'chr15', 'chr16', 'chr17', 'chr18', 'chr19', 'chr20', 'chr21', 'chr22', 'chrX', 'chrY']

def blob_key(item):
    item_id = item.replace("chr", "")
    if item_id.isdigit():
        return int(item_id)
    return item_id

blobs.sort(key=blob_key)

print blobs

输出： ['chr1'，'chr2'，'chr3'，'chr4'，'chr5'，'chr6'，'chr7'，'chr8'，'chr9'，'chr10' ，'chr11'，'chr12'，'chr13'，'chr14'，'chr15'，'chr16'，'chr17'，'chr18'，'chr19 '，'chr20'，'chr21'，'chr22'，'chrX'，'chrY']

blob_key函数接收一个项（在本例中是一个字符串）并返回与该项关联的键（如果该项是整数，则关联整数键，在另一种情况下：使用chr之后的字符串），然后使用该键进行排序，由于Python在排序时将整数放在字符串之前，因此输出就是我们想要的。

Answer 3

试试lambda

sorted(var, key=lambda var: int(var[3:]) if var[3:].isdigit() else var[3:])