我正在写一些代码,目的是将不明确的DNA代码翻译成可能的氨基酸,我看到了一些来自Biopython 1.56软件包的奇怪翻译。它似乎是在把模棱两可的DNA代码翻译成“J”,而“J”并不是任何东西的代码。我在macos10.6.6上运行python2.6.1。在
例如:
>>>from Bio.Seq import *
>>>translate('ARAWTAGKAMTA')
'XJXJ'
或者
^{pr2}$我已经看过了Bio.Data.CodonTable公司来源和生物序列消息人士和我找不到发生这种事情的原因。有什么想法吗?在
谢谢!在
马克
J是亮氨酸(L)或异亮氨酸(I),用于质谱(NMR)。在
另请参见http://biostar.stackexchange.com/questions/5688/biopython-translation-error
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