在哪里存储执行生物信息学分析的Python脚本？

Question

我用Python编写了一个分析管道，我认为它对其他人很有用。我想知道在GitHub中发布这样的脚本是否是一种习惯，是否有一个特定的地方可以为Python脚本做这件事，或者甚至还有一个更具体的地方来存放与生物学相关的Python脚本。在

Answer 1

您也可以在sourceforge上发布它。所有类型的科学、工程等脚本都会发布，数百万人下载这些脚本。Github也是一个不错的选择，但我相信sourceforge在观众和下载中更受欢迎。另外，你可以发布一个openwetwarewiki并在那里发布代码，openwetware是一个科学使用的wiki系统，我以前用过它并推荐它。或者，您可以通过镜像将两个伟大的开源平台sourceforge和github链接起来，这样您的项目就基本上“同步”到这两个平台： 看看这个：

http://www.17od.com/2010/11/11/migrating-a-sourceforge-subversion-repository-to-github/-概述 http://www.xcore.com/forum/viewtopic.php?f=3&t=162-如何实际镜像

Answer 2

另一个选择是在bioinformatics.org上发布它。在

Answer 3

虽然有很多方法可以解决这一问题，但通常的解决方案之一就是在github上发布它，然后从你的研究机构的网站链接到它。在