我有一个python代码,它在后台运行一个matlab函数sussum(a,nx,ny)子流程.Popen. 我不能让它工作。因为我无法将输入参数正确地传递给matlab。下面是python代码:
#!/usr/bin/env python
import matlab.engine
import scipy.io as sio
import numpy as np
import subprocess as sb
nproc = 5
input = sio.loadmat('sus_py.mat')
totq = input['totq']
nx,ny = input['nx'],input['ny']
nq = totq+1
nx,ny = matlab.int32(nx.tolist()) , matlab.int32(ny.tolist())
iq = range(1,nq)
gp = len(iq)/nproc
list = [iq[j:j+nproc] for j in range(0,len(iq),nproc)]
for g in range(0,len(list)):
i = len(list[g])
p = []
for n in range(0,i):
a = matlab.int32(list[g][n])
fun = '-r "sussum(a,nx,ny); exit" '
lmb = ['/usr/local/bin/matlab','-nodesktop','-nosplash','-nodisplay','-nojvm',fun]
p.append(sb.Popen(lmb))
for q in p:
q.wait()
python脚本在集群网络的命令终端中执行,直到它发出错误消息:Undefined function or variable'a'。在
我确信matlab函数sussum(a,nx,ny)工作得很好,因为我已经用Python matlabapi as进行了测试matlab.engine.start_matlab().sussum(a,nx,ny)并给出所需的输出。在运行python代码时有什么帮助吗子流程.Popen()将不胜感激。在
当您使用
subprocess.Popen(args)
创建一个Popen
对象时,您实际上是在使用它将lmb
列表的内容(用空格连接)传递给要执行的shell。在这种情况下,相当于您的命令是:显然,如果您直接从shell运行它,这将导致一个错误,因为这个命令创建的MATLAB实例不知道}是变量,在本例中,shell只将它传递的整个字符串作为
a
、nx
和{-r
参数的参数。如果您是从命令行运行它,那么您需要将这些符号替换为值,这些值在传递到MATLAB时意味着什么。您可以通过在命令本身中手动写入变量来实现这一点,也可以对所使用的shell使用适当的变量扩展方法。在在您尝试通过Python
^{pr2}$Popen
对象运行它的情况下,您需要将变量替换为实际的fun
字符串。如果您在Python中严格地使用来执行此操作,则可以执行以下操作不幸的是,由于您要从}值从}值,因此您还有更多的工作要做,以便从中提取值并将它们格式化为
scipy.io.loadmat
给您的a
、nx
和{scipy.io.loadmat
提供给您的nx
和{sussum
函数可以接受的格式。在相关问题 更多 >
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