在python中以同一行打印

Question

我对python还不熟悉，我需要你的帮助。在

我有一个这样的文件：

>chr14_Gap_2
ACCGCGATGAAAGAGTCGGTGGTGGGCTCGTTCCGACGCGCATCCCCTGGAAGTCCTGCTCAATCAGGTGCCGGATGAAGGTGGT
GCTCCTCCAGGGGGCAGCAGCTTCTGCGCGTACAGCTGCCACAGCCCCTAGGACACCGTCTGGAAGAGCTCCGGCTCCTTCTTG
acacccaggactgatctcctttaggatggactggctggatcttcttgcagtccaaggggctctcaagagt
………..
>chr14_Gap_3
ACCGCGATGAAAGAGTCGGTGGTGGGCTCGTTCCGACGCGCATCCCCTGGAAGTCCTGCTCAATCAGGTGCCGGATGAAGGTGGT
GCTCCTCCAGGGGGCAGCAGCTTCTGCGCGTACAGCTGCCACAGCCCCTAGGACACCGTCTGGAAGAGCTCCGGCTCCTTCTTG
acacccaggactgatctcctttaggatggactggctggatcttcttgcagtccaaggggctctcaagagt
………..

一个字符串作为标记，另一个字符串代表dna序列。 我要计算N个字母的个数和小写字母的个数，然后取百分比。 我写了下面的脚本，但我有一个打印问题。在

^{pr2}$

它可以在第一行打印标记，在第二行打印waste变量，如下所示：

chr10_Gap_18759
The waste persentage is: 52.0

我怎样才能在同一行打印，制表符分开？在

例如

chr10_Gap_18759      52.0 
chr10_Gap_19000      78.0 
…….

非常感谢。在

Answer 1

不要在(i%2 == 0)时打印name，只需将其保存在变量中，并在下一次迭代中与百分比一起打印：

 print("{0}\t{1}".format(name, round(waste)))

This method of string formatting (new in version 2.6) is the new standard in Python 3, and should be preferred to the % formatting described in String Formatting Operations in new code.

Answer 2

您可以用以下方式打印：

print name, "\t", round(waste)

如果您使用的是python2.X 我会对你的代码做些修改。python的argparse模块用于从命令行管理参数。我会这样做：

^{pr2}$

您也可以像其他答案一样用print("{}\t{}".format(name, round(waste)))打印它

我不确定i%2的用法，请注意，如果序列使用和奇数行数，则在同一事件发生之前，您将无法获得下一个序列的名称。我会检查该行是否以“>；”开头，然后使用store the name，并将下一行的字符相加。在

Answer 3

我已经修复了缩进和冗余：

#!/usr/bin/python
"""
This script reads the sequences of the desert areas (fasta files) and calculates the percentage of the Ns and the repeats.
2014-10-05 v1.0 by Vasilis
2014-10-05 v1.1 by Llopis
2015-02-27 v1.2 by Cees Timmerman
"""

import argparse

parser = argparse.ArgumentParser()
parser.add_argument("fasta_file", help="The fasta file to be processed.", type=str)
args = parser.parse_args()

with open(args.fasta_file, "r") as f:
    for line in f.readlines():
        line = line.strip()
        if line[0] == '>':
            name = line.split(">")[1]
            print name,
        else:
            numberOfN = line.count('N')
            allChar = len(line)
            lowerChars = sum(1 for c in line if c.islower())
            Ns_percentage = 100 * (numberOfN/float(allChar))
            lower_percentage = 100 * (lowerChars/float(allChar))
            waste = Ns_percentage + lower_percentage

            print "\t", round(waste)  # Note: https://docs.python.org/2/library/functions.html#round

美联储：

^{pr2}$

给出：

C:\Python27\python.exe -u "dna.py" fasta.txt
Process started >>>
chr14_Gap_2     29.0
chr14_Gap_3     29.0
<<< Process finished. (Exit code 0)

使用我最喜欢的pythonide:Notepad++和NppExec plugin。在