匹配包含d的字符串

Question

我试图在文本文件中找到一些单词并替换它们。 我把要替换的单词存储在变量中。例如：

COR00g1.1   SolycCB00g000010

因此，在文本中，我需要找到“COR00g1.1”单词并替换为“SolycCB00g000010”。问题是“COR00g1.1”实际上是在匹配另一个单词。 示例：

输入：

^{pr2}$

输出：

ch00 assembler  exon    1146259 1146582 .   -   .   ID=exon2;Parent=SolycCB00g000010.2,SolycCB00g000010.3

ch00 assembler  transcript  4197578 4197801 .   +   . Parent=SolycCB00g000010.1;ID=SolycCB00g000010.1.1;official=no

可以看到，第二行也被替换为新的ID，而它不应该被替换

这是我使用的代码：

with open(fname, "r") as dataf:
    reader = csv.reader(dataf, delimiter="\t")
    for line in reader:
        line[8] = re.sub(search, replace, line[8])

Answer 1

I know the problem, but I do not know how to avoid it

您需要的是一个已定义的子字符串，而不是模式，所以首先不要使用正则表达式。在

简单的子字符串替换如下所示：

line[8] = line[8].replace('COR00g1.1', 'SolycCB00g000010')

如果必须使用正则表达式，则需要转义.，以便将其视为文字字符：例如

^{pr2}$

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编辑：要处理此评论：

I have a list of words to be replaced, and I'm calling a function to replace them two by two

并不意味着你需要使用正则表达式，它只是意味着你需要使用变量。例如：

def searchAndReplace(search, replace):
    # your code here
    line[8] = line[8].replace(search, replace)

在需要正则表达式的地方传递一个文本字符串，然后咀嚼该字符串以希望能够转义所有特殊的正则表达式字符，这是所有世界中最糟糕的。在

如果只需要简单的子字符串匹配，那么使用正则表达式没有任何好处，而且增加了显著的复杂性。套用众所周知的Jamie Zawinski quote，您创建了一个没有任何好处的额外问题。在