在一个大型应用程序中捆绑多个独立但相关的python工具

Question

我一直在寻找实现这一目标的方法，但没有找到

我有多个python脚本，其中一些是预处理实用工具，一些执行数据分析，一些创建可视化。它们都是相关的，但可能是依赖的，也可能不是依赖的，并且可能有单独的输入参数。我试图在一个包中创建一套工具，并希望用户根据自己的需要选择和运行工具/模块

例如： 下面是一个名为GATK的基于java的软件。“gatk”是一个.jar，它包含几个工具，其中一个是“annotateinterval”，它有一组输入需求。用户这样运行它

gatk AnnotateIntervals \ -R reference.fa \ -L intervals.interval_list \ --interval-merging-rule OVERLAPPING_ONLY \ -O annotated_intervals.tsv

https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360040098252-AnnotateIntervals

我想在python中开发类似的东西

main_app.py first_module -l <> -m <>这可能吗？如果是这样，我如何才能做到这一点

Answer 1

您可能想阅读setuptools' entry-points和/或argparse's sub-commands。这只是一种组合，可能是最“标准”的组合，但还有许多其他选择（poetry、flit、click、fire等等）