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Python常见问题
我有来自体外SELEX实验的FASTA文件。理论上，所有读数应以相同的6个碱基（核心序列：GCTGCT）开始，且长度相等-27nt。事实上，有些读取甚至在核心序列的10个碱基之后开始，并继续执行21个nt的其余部分。我想用核心序列提取序列，而不管读取核心序列的位置如何。开始，然后将读数裁剪到27nt
示例（粗体区域是我要提取的区域：
读1GCTGCTTTCGCTTTCCTTGCGGCCAAAA
阅读2 GACGTGCTGCTGCTATTTTGCTTTCCTTGTCCATGAA
这里read1从核心序列开始，需要裁剪到27。这一部分很容易做到。问题在于read2中的核心序列开始较晚，我不能直接裁剪到27nt，而是在核心序列开始之后裁剪到27nt。我希望输出为FASTA格式
有没有人知道一个工具可以做到这一点，或者有其他建议
Tags： 文件区域示例核心序列理论fasta读数
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