在我的conda环境中导入matplotlib时导入错误：无法从“PIL”导入名称“\u imaging”

Question

我是这个领域的新手，很抱歉可能会犯愚蠢的错误。 我与snakemake合作，因此我按照他们的指示创建了一个conda环境：

conda install -c conda-forge mamba
mamba create -c conda-forge -c bioconda -n snakemake snakemake

但是，当我运行基本教程（enter link description here）时，发生了ModuleNotFoundError：

snakemake --cores 1

ModuleNotFoundError: No module named 'matplotlib'

因此，我已使用conda forge安装matplotlib：

conda install -c conda-forge matplotlib 

然而，当我重新运行教程时，我得到了一个可怕的消息：

ImportError: cannot import name '_imaging' from 'PIL' (/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/init.py) So I decided to install in the same conda environment also pillow:

conda install -c conda-forge pillow 

但是我在运行教程时遇到了同样的错误

所有导入的软件包都来自my conda环境：

anaconda3/envs/snakemake/lib/python3.9/site-packages

除PIL/枕头路径外，该路径从以下位置导入：

usr/lib/python3/dist-packages

我还更新了conda、anaconda和snakemake环境中的所有包。此外，我用conda list检查了PIL的存在，它实际存在于我的蛇形环境中，路径与其他软件包（anaconda3/envs/snakemake/lib/python3.9/site软件包）相同

我注意到，在其他问题中，建议卸载并重新安装枕头。 但是，当我尝试卸载时：

pip uninstall Pillow

及

pip3 uninstall Pillow

我获得：

PermissionError: [Errno 13] Permesso negato: 'BlpImagePlugin.cpython-38.pyc'

因此，我尝试强制升级：

pip install -U Pillow --user

及

pip3 install -U Pillow --user

终端声明我已经成功安装了Pillow 8.0.1。但是，当我导入matplotlib时，会发生相同的错误：

ImportError: cannot import name '_imaging' from 'PIL' (/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/init.py)

我很感激你给我的任何提示 多谢各位

Answer 1

我猜你错过了教程（https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/tutorial/setup.html）设置中的一个部分。在步骤2中，下载environment.yaml并使用它安装所有需要的软件包。或者您可以自己尝试安装所有软件包，请查看“需求”下的列表

Answer 2

解决了从系统PIL包卸载的问题：

sudo apt-get remove python-pil

我仍然不知道它为什么会工作，但至少现在我可以正确地使用matplotlib