Python寻找最长的ORF

Question

有人能给我一个简单的方法来计算最长的开放阅读框（ORF）>；DNA序列的长度是30个碱基？ATG是起始密码子（即ORF的开始），TAG、TGA和TAA是终止密码子（即ORF的结束）。没有使用生物粒子

Answer 1

此正则表达式可能能够完成以下任务：

ATG(...){30,}(TAG|TGA|TAA)

(...)是一个三个字母的密码子，它与{30，}匹配30次或更多次，并在找到其中一个时停止

这个正则表达式可以帮助您找到所有的ORF，现在您只需要找到最长的ORF，这应该是微不足道的