如何对光谱数据执行PCA？

Question

我有一些.csv格式的分子光谱（FTIR）数据，我希望能够使用Python中的主成分分析（PCA）对这些分子进行可视化和分类

有9个相关的.csv文件（每个分子一个）。在每个.csv文件中，有两列：波数（反厘米）和透射比（%）。如何获取所有9个分子的数据，然后使用PCA进行可视化和分类？再说一遍，用Python？任何能够对多个信号数据执行此操作的教程或代码源的链接都将非常有用

谢谢

Answer 1

您可以将它们读取并合并到单个数据帧中

波数在列中，透射比在9行中，apply PCA用于降维和可视化（example）

或者，您可以首先从9个光谱中提取特征（最大透射比、最小透射比、质心波长等），然后在此特征空间（example）中应用PCA