为什么Python的shutil.which（）不起作用？

Question

我试图看看shutil.which()是否能从NCBI的BLAST中找到blastn命令。在我的终端上运行which blastn会导致/usr/local/bin/blastn。但是，如果我执行shutil.which("blastn")，它只返回None。搜索Python工作正常，因为shutil.which("python")返回/usr/bin/python。为什么会这样

Answer 1

这意味着shell中的环境与Python运行时中的环境具有不同的路径。有许多可能的原因，但这种情况经常发生，因为.bashrc中的某些内容附加到路径，这将在shell中看到，但Python不会看到

要检查shell中的环境，请执行以下操作：

$ echo $PATH

要在Python中检查环境，请执行以下操作：

import os
print(os.environ["PATH"])

您可能会发现shell的环境在PATH中有blastn的位置，而Python的环境没有