在python中加速读取非常大的netcdf文件

2024-06-06 16:50:27 发布

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我有一个非常大的netCDF文件,我正在python中使用netCDF4读取它

我不能一次全部读取这个文件,因为它的尺寸(1200 x 720 x 1440)太大,整个文件不能一次放入内存。第一个维度表示时间,下两个维度分别表示纬度和经度。

import netCDF4 
nc_file = netCDF4.dataset(path_file, 'r', format='NETCDF4')
for yr in years:
    nc_file.variables[variable_name][int(yr), :, :]

然而,一年一次的阅读是极其缓慢的。如何在下面的用例中加快速度?

--编辑

块大小为1

  1. 我可以读取一系列年份:nc_文件。变量[变量名][0:100,:,:]

  2. 有几个用例:

    多年来:

    numpy.ma.sum(nc_file.variables[variable_name][int(yr), :, :])
    

# Multiply each year by a 2D array of shape (720 x 1440)
for yr in years:
    numpy.ma.sum(nc_file.variables[variable_name][int(yr), :, :] * arr_2d)

# Add 2 netcdf files together 
for yr in years:
    numpy.ma.sum(nc_file.variables[variable_name][int(yr), :, :] + 
                 nc_file2.variables[variable_name][int(yr), :, :])

Tags: 文件nameinnumpyforvariablesvariablefile