Python scipy 需要 BLAS

Question

我在我的Python程序中需要用到scipy这个库，现在我想用setuptools把它打包。

我在setup.py文件里写了install_requires=['scipy','matplotlib']，意思是我需要这两个库。

然后我运行了python setup.py install。

Processing dependencies for Bland==1.0.a.dev1
Searching for scipy
Reading http://pypi.python.org/simple/scipy/
Best match: scipy 0.13.3
Downloading https://pypi.python.org/packages/source/s/scipy/scipy-0.13.3.zip#md5=20ff3a867cc5925ef1d654aed2ff7e88
Processing scipy-0.13.3.zip

这个过程一直进行，直到出现3到4个警告和一个错误，内容如下：

ages/numpy/distutils/system_info.py:1522: UserWarning: 
    Atlas (http://math-atlas.sourceforge.net/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [atlas]) or by setting
    the ATLAS environment variable.
  warnings.warn(AtlasNotFoundError.__doc__)
/home/storm/Documents/bland/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/distutils/system_info.py:1531: UserWarning: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting
    the BLAS environment variable.
  warnings.warn(BlasNotFoundError.__doc__)
/home/storm/Documents/bland/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/distutils/system_info.py:1534: UserWarning: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) sources not found.
    Directories to search for the sources can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas_src]) or by setting
    the BLAS_SRC environment variable.
  warnings.warn(BlasSrcNotFoundError.__doc__)
error: 
    Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting
    the BLAS environment variable

我找到了一些信息，提到过这个问题，链接在这里：这个问题。这个信息是关于如何在没有setup.py的情况下安装scipy，它提到需要下载，然后编译Fortran文件，最后把它们链接成一个库，这个库在安装scipy时必须在你的搜索路径里。但是我该如何在setup.py中做到这一点，或者有没有其他的解决办法呢？

顺便说一下：我是在virtualenv环境中运行这个的。

Answer 1

根据我的理解，你不能通过 setup.py 来安装系统库。这个方法只是用来处理 Python 包和它们的 C 扩展（这些扩展可能会定义它们自己对 C 共享库的依赖，但这并不是解决方案）。

你可以尝试一些其他的解决办法，但这些都不在 setup.py 文件里：

• 创建一个安装程序（比如 RPM、DEB 或 Windows 包），在里面定义你对 Atlas 包的依赖。然后系统的包管理工具（如 yum、apt-get，Windows 上没有类似的）会负责找到这个库并为你的包安装它。
  • RPM: 记得你可以直接从 setup.py 使用 bdist_rpm 命令
  • Windows: 记得你也可以从 setup.py 使用 bdist_msi 命令
  • DEB: stdeb 包 可以创建 bdist_deb 命令
• 使用 buildout 作为构建工具
  • 把 Atlas 定义为一个 part
  • 使用 cmmi 配方来下载、配置、编译和安装 Atlas 的压缩包
  • 在你的 setup.py 文件中，在定义你的包的 setup 之前，把 os.environ 的 ATLAS 变量设置为你 buildout 的 parts 目录。
• 简单地把 Atlas 列为你包的依赖，让用户自己去安装它。把 scipy 的依赖放在你的 setup.py 里；这是正确的地方，因为它是一个 Python 包。