动态定义函数
我正在尝试写一个曲线拟合的函数,这个函数可以返回最佳的参数 a、b 和 c。下面是一个简化的例子:
import numpy
import scipy
from scipy.optimize import curve_fit
def f(x, a, b, c):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
xdata = numpy.array([1,3,6,8,10])
ydata = numpy.array([ 0.91589774, 4.91589774, 10.91589774, 14.91589774, 18.91589774])
popt, pcov = scipy.optimize.curve_fit(f, xdata, ydata)
这个方法运行得很好,但我想给用户一个机会,让他们可以提供一些(或者不提供)参数 a、b 或 c。如果用户提供了这些参数,它们就应该被当作常量,而不是去估算。那么我该如何编写 f
,使它只拟合用户没有提供的参数呢?
简单来说,我需要动态定义 f
,让它接受正确的参数。例如,如果用户已经知道了 a
,那么 f
就变成:
def f(x, b, c):
a = global_version_of_a
return x * 2*a + 4*b - 5*c
5 个回答
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如果你想要一个简单的解决方案,可以使用 curve_fit
,我建议你把你的函数放在一个类里面。下面是一个最简单的例子:
import numpy
from scipy.optimize import curve_fit
class FitModel(object):
def f(self, x, a, b, c):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
def f_a(self, x, b, c):
return self.f(x, self.a, b, c)
# user supplies a = 1.0
fitModel = FitModel()
fitModel.a = 1.0
xdata = numpy.array([1,3,6,8,10])
ydata = numpy.array([ 0.91589774, 4.91589774, 10.91589774, 14.91589774, 18.91589774])
initial = (1.0,2.0)
popt, pconv = curve_fit(fitModel.f_a, xdata, ydata, initial)
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我通常会用一个lambda表达式来实现这个目的。
user_b, user_c = get_user_vals()
opt_fun = lambda x, a: f(x, a, user_b, user_c)
popt, pcov = scipy.optimize.curve_fit(opt_fun, xdata, ydata)
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借鉴collections.namedtuple的思路,你可以使用exec来“动态”定义func
:
import numpy as np
import scipy.optimize as optimize
import textwrap
funcstr=textwrap.dedent('''\
def func(x, {p}):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
''')
def make_model(**kwargs):
params=set(('a','b','c')).difference(kwargs.keys())
exec funcstr.format(p=','.join(params)) in kwargs
return kwargs['func']
func=make_model(a=3, b=1)
xdata = np.array([1,3,6,8,10])
ydata = np.array([ 0.91589774, 4.91589774, 10.91589774, 14.91589774, 18.91589774])
popt, pcov = optimize.curve_fit(func, xdata, ydata)
print(popt)
# [ 5.49682045]
注意这一行
func=make_model(a=3, b=1)
你可以随意传递参数给make_model。你传给make_model
的参数会变成func
中的固定常量。而剩下的参数则是自由参数,optimize.curve_fit
会尝试去调整这些参数。
举个例子,上面提到的a=3和b=1就变成了func
中的固定常量。实际上,exec
语句把它们放在了func
的全局命名空间里。因此,func
被定义为一个关于x
和单个参数c
的函数。注意,popt
的返回值是一个长度为1的数组,对应于剩下的自由参数c
。
关于textwrap.dedent
:在上面的例子中,调用textwrap.dedent
其实是多余的。但在“真实”的脚本中,如果funcstr
是在一个函数内部定义的,或者缩进层级更深,使用textwrap.dedent
可以让你写出
def foo():
funcstr=textwrap.dedent('''\
def func(x, {p}):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
''')
而不是看起来不太美观的
def foo():
funcstr='''\
def func(x, {p}):
return x * 2*a + 4*b - 5*c
'''
有些人更喜欢
def foo():
funcstr=(
'def func(x, {p}):\n'
' return x * 2*a + 4*b - 5*c'
)
但我觉得逐行引用并添加明确的换行符有点麻烦。不过,这样确实可以省去一次函数调用。