OS X Lion上的SciPy

Question

我正在尝试在 OS X Lion 上搭建我的 Python/Numpy/SciPy 开发环境。

我已经成功从最新的源代码版本编译了 Numpy 和 SciPy，使用的是常规的方法：

python setup.py build
python setup.py install

我使用的是从 python.org 下载的 Python 2.7.2 版本：

tobi-mbp:~ tobi$ python
Python 2.7.2 (v2.7.2:8527427914a2, Jun 11 2011, 15:22:34) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>>

但是当我导入 Numpy 时，它显示的是：

>>> import numpy
>>> numpy.__version__
'1.5.1'
>>> numpy.__file__
'/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/__init__.pyc'
>>>

系统安装的 Numpy。而对于：

>>> import scipy
>>> scipy.__version__
'0.10.0.dev'
>>> scipy.__file__
'/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/scipy/__init__.pyc'
>>>

则显示已安装的 SciPy 版本。这意味着 scipy.test() 失败了，实际上还卡住了。

我也尝试过使用 pip 和 easy_install，但它们都无法编译 SciPy，Numpy 也出现了同样奇怪的情况。对于在 SourceForge 提供的预编译二进制文件也是如此。

这似乎是 PYTHONPATH 的问题：

>>> import sys, os, pprint
>>> pprint.pprint(sys.path)
['',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/distribute-0.6.19-py2.7.egg',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pip-1.0.2-py2.7.egg',
 '/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python',
 '/Library/Python/2.7/site-packages/nose-1.1.2-py2.7.egg',
 '/Library/Python/2.7/site-packages/pip-1.0.2-py2.7.egg',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python27.zip',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/plat-darwin',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/plat-mac',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/plat-mac/lib-scriptpackages',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-tk',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-old',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-dynload',
 '/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages',
 '/Library/Python/2.7/site-packages']
>>> pprint.pprint([p for p in os.environ.items() if p[0].startswith('PYTHON')])
[]
>>>

还有 site-packages 的内容列表：

tobi-mbp:site-packages tobi$ ls -l
total 752
-rw-rw-r--   1 root  admin     119 12 Jun 00:25 README
drwxr-xr-x  10 root  admin     340  6 Aug 19:47 distribute-0.6.19-py2.7.egg
-rw-r--r--   1 tobi  admin     237  6 Aug 19:48 easy-install.pth
drwxrwxr-x  48 tobi  admin    1632  6 Aug 18:19 numpy
drwxrwxr-x   6 tobi  admin     204 20 Jul 20:44 numpy-1.6.1-py2.7.egg-info
-rw-r--r--   1 root  admin    1670  6 Aug 18:19 numpy-2.0.0.dev_26aa3cf-py2.7.egg-info
drwxr-xr-x   4 root  admin     136  6 Aug 19:48 pip-1.0.2-py2.7.egg
drwxr-xr-x   8 tobi  admin     272  6 Aug 19:48 readline-6.2.0-py2.7.egg-info
-rwxr-xr-x   1 tobi  admin  357048  6 Aug 19:48 readline.so
drwxrwxr-x  42 tobi  admin    1428  6 Aug 18:21 scipy
-rw-r--r--   1 root  admin    1768  6 Aug 18:21 scipy-0.10.0.dev-py2.7.egg-info
drwxrwxr-x   6 tobi  admin     204 27 Feb 14:00 scipy-0.9.0-py2.7.egg-info
-rw-r--r--   1 tobi  admin     144  6 Aug 19:47 setuptools-0.6c11-py2.7.egg-info
-rw-r--r--   1 tobi  admin      30  6 Aug 19:47 setuptools.pth

tobi-mbp:site-packages tobi$ more easy-install.pth
import sys; sys.__plen = len(sys.path)
./distribute-0.6.19-py2.7.egg
./pip-1.0.2-py2.7.egg
import sys; new=sys.path[sys.__plen:]; del sys.path[sys.__plen:]; p=getattr(sys,'__egginsert',0); sys.path[p:p]=new; sys.__egginsert = p+len(new)

tobi-mbp:site-packages tobi$ more setuptools.pth 
./distribute-0.6.19-py2.7.egg

我在路径中看到了 System Extras 文件夹，现在的问题是为什么会有这个文件夹，以及我该如何去掉它。

谢谢你的帮助。

祝好，Tobi

编译 numpy scipy 开发环境 site-packages easy_install pip os x lion

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