从Python 3.1.1到R的最佳接口是什么？
我在Mac OS X 10.6.2上使用Python 3.1.1，需要一个可以和R语言对接的工具。在网上浏览时，我发现了RPy这个东西。请问这是个合适的选择吗？
现在，我的Python程序计算了一个距离矩阵，并把它存储在一个文件里。我会单独打开R，手动读取这个矩阵进行聚类分析。为了简化计算，我可以为R准备一个脚本文件，然后从Python调用它，再把结果读回来。因为我刚开始学Python，所以不想退回到2.6版本。
3 个回答
我觉得对于Python 3.1.1来说，没有什么可用的选项。
关于R-Python绑定的现状：
目前有三个选择：RPy、RPy2和RSPython。
RPy和RPy2是同一开发团队开发和维护的；RPy2是对RPy的重大重写，而RPy又是基于Omega hat的RSPython。
RPy仍然在积极维护中。
RSPython虽然还可以使用，但我认为它不再积极开发了。我几个月前查了一下，发现的最新版本（0.7-1）是在2006年10月发布的。
RPy2的最新稳定版本和开发版本（2.1 rc）是为R版本2.10（当前稳定版本）和Python版本2.6优化的（也就是说，这些是开发中使用的版本）。我不知道RPy2的开发者有没有宣布支持Python 3.x的版本。
编辑：重写以总结随着时间积累的修改。
目前的 rpy2 版本（2.3.x 系列）完全支持 Python 3.3，但对于 Python 3.0、3.1 或 3.2 并没有做出任何承诺。
在写这段文字时，下一版 rpy2（正在开发中，2.4.x 系列）只支持 Python 3.3。
关于 Python 3 支持的历史：
rpy2-2.1.0-dev / 仓库中的 Python 3 分支 - 实验性支持，这是一个 Google 夏季编码项目，目的是将 rpy2 移植到 Python 3（在 Python 的支持下）
这个项目获得了批准，感谢 Google 的资金支持，Python 3 的功能慢慢被整合进主代码库（在 GSoC 之后还有很多工作要做，最终完成了 2.2.x 版本的分支）。