Lomb-Scargle与FFT功率谱:均匀间隔数据下的崩溃

4 投票
1 回答
1143 浏览
提问于 2025-04-18 12:58

我正在尝试创建一些程序,用来计算均匀和不均匀采样数据的功率谱,使用的是Lomb-Scargle周期图(LSP)和快速傅里叶变换(FFT)功率谱。我的问题是,当我在scipy中使用LSP处理均匀采样的数据时,程序会崩溃。

下面的代码可以正常运行,并且输出结果几乎完全相同(而且是正确的),就我所知是这样的。不过,我不得不在Lomb-Scargle函数里加了一个小技巧,给频率添加了一些随机抖动,这样它们就不会和FFT的结果完全一致。当我把那行代码注释掉时,就会出现除以零的错误。

这是scipy中Lomb-Scargle实现的问题,还是说我根本不应该用它来处理均匀采样的数据呢?谢谢!

import numpy as np
import scipy.signal as sp
import matplotlib.pyplot as plt

def one_sided_fft(t,x):
    full_amplitude_spectrum = np.abs(np.fft.fft(x))/x.size
    full_freqs = np.fft.fftfreq(x.size, np.mean(np.ediff1d(t)))
    oneinds = np.where(full_freqs >=0.0)
    one_sided_freqs = full_freqs[oneinds]
    one_sided_amplitude_spectrum=2*full_amplitude_spectrum[oneinds]
    return one_sided_freqs, one_sided_amplitude_spectrum

def power_spectrum(t,x):
    onef, oneamps = one_sided_fft(t,x)
    return onef, oneamps**2

def lomb_scargle_pspec(t, x):
    tstep = np.mean(np.ediff1d(t))
    freqs = np.fft.fftfreq(x.size, tstep)
    idxx = np.argsort(freqs)
    one_sided_freqs = freqs[idxx]
    one_sided_freqs = one_sided_freqs[one_sided_freqs>0]
    #KLUDGE TO KEEP PERIODOGRAM FROM CRASHING
    one_sided_freqs = one_sided_freqs+0.00001*np.random.random(one_sided_freqs.size)
    #THE FOLLOWING LINE CRASHES WITHOUT THE KLUDGE
    pgram = sp.lombscargle(t, x, one_sided_freqs*2*np.pi)
    return one_sided_freqs, (pgram/(t.size/4))


if __name__ == "__main__":

    #Sample data
    fs = 100.0
    fund_freq=5
    ampl = 0.4
    t = np.arange(0,10,1/fs)
    x = ampl*np.cos(2*np.pi*fund_freq*t)

    #power spectrum calculations
    powerf, powerspec = power_spectrum(t,x)
    lsf, lspspec = lomb_scargle_pspec(t,x)

    #plotting
    fig, (ax0, ax1, ax2)= plt.subplots(nrows=3)
    fig.tight_layout()
    ax0.plot(t, x)
    ax0.set_title('Input Data, '+str(fund_freq)+' Hz, '+
                  'Amplitude: '+str(ampl)+
                  ' Fs = '+str(fs)+' Hz')
    ax0.set_ylabel('Volts')
    ax0.set_xlabel('Time[s]')

    ax1.plot(powerf, powerspec)
    ax1.set_title('FFT-based Power Spectrum')
    ax1.set_ylabel('Volts**2')
    ax1.set_xlabel('Freq[Hz]')

    ax2.plot(lsf, lspspec)
    ax2.set_title('Lomb-Scargle Power Spectrum')
    ax2.set_ylabel('Volts**2')
    ax2.set_xlabel('Freq[Hz]')

    plt.show()

1 个回答

6

这是一个关于 lombscarglebug。代码里有一个反正切的计算,写成了 atan(2 * cs / (cc - ss)),其中 ccss 是根据 xfreqs 的某些元素计算出来的。对于某些输入,cc - ss 可能会等于 0。修复后的代码使用了 atan2(2 * cs, cc - ss),这个修复在 scipy 0.15.0 版本中被包含进来了。

撰写回答