在venomseq工作流中执行数据分析的python代码
VenomSeq的Python项目详细描述
VenomSeq
下一代测序工作流程，用于发现毒液与人类疾病之间的治疗关联。
这是什么？
毒液为药物的发现提供了极好的机会。在人类历史的长河中，已经发现了数千种毒液的治疗用途，近几十年来，这些毒液中的一些被转化为fda批准的药物。然而，这些影响大多是偶然发现的，其余的只是经过几十年的系统研究才发现的。
VenomSeq是一个旨在改变这一状况的工具，它提供了一种新的方法来生成高思想量的测序数据，用于以可伸缩、廉价的方式对应用于人类细胞系的毒液进行微扰差异表达分析。
我们正在准备一份详细描述VenomSeq的预印本，一旦有链接，我们将在这里发布。
这个python包包含分析由VenomSeq生成的数据所需的算法和数据结构。
系统要求
VenomSeq已经在macos 10.14.2和windows10上用python 3.6进行了测试。如果您想帮助我们在当前不受支持的平台上进行测试，请提交问题或请求。
安装
来源：
git clone https://github.com/JDRomano2/venomseq
cd venomseq
pip3 install .
来自PYPI:
pip3 install venomseq
运行示例
位于{{CD6>}的JUJYTER笔记本文件提供了一个将现有的{{CD1>}分析加载到内存中的示例，并创建了几个解释结果的可视化。用户将不得不下载几个（大）外部文件，其中包含已处理的数据和元数据（这些文件太大，无法包含在源发行版中）。
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