用stan自适应退火热力学积分
TIStan的Python项目详细描述
提斯坦
tistan是一个python 3包,它实现了用于模型证据估计的自适应退火热力学集成。这个软件包使用PyStan的无U形回转取样器的实现来刷新每次逆温增量下的样本总体。很快就会发表一篇论文,详细描述这个软件包,届时会链接到这里。
安装
此软件包可以使用pip安装:
pip install TIStan
提斯坦依赖于派斯坦、努比和迪尔。如果您的python安装中没有这些包,那么这些包应该由pip自动安装。
测试
安装之后,可以运行一个虚拟测试,以确保所有内容都安装正确。此测试将不会产生有效的证据值。从python 3控制台运行,
from TIStan.tests import tests
out = tests.dummy_test()
要运行更彻底的测试,该测试应为运行示例问题生成有效的证据值,
from TIStan.tests import tests
out = tests.full_test()