综合自我-CRISPR编辑推理(ICE)
synthego-ice的Python项目详细描述
ICE工具是一个CRISPR编辑分析工具,可以推断是否存在indels和其他突变。ICE使用非负最小二乘回归来检测编辑的存在或证据。与tide1相比,ice可以分析插入、删除、hdr、多重编辑和基本编辑,并且可以为非商业用途提供开源(有关详细信息,请参阅许可证)。ICE还可用于分析其他基因组工程方法,如Talen和归巢核酸内切酶。
有关详细信息,请访问https://github.com/synthego-open/ice。
https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/20/251082
中描述的算法