生存分析的斯坦模型库
survivalstan的Python项目详细描述
……survival stan文档主文件,由
Sphinx Quickstart于2017年1月6日06:25:53创建。
您可以完全根据自己的喜好调整此文件,但它至少应包含根“toctree”指令。
===br/>
survivalstan是用“stan<”编写的生存模型库;http://mc stan.org>;``它还包含许多实用函数,在进行生存分析时非常有用。
典型用法:
:
准备数据
fit1=survival stan.fit_stan_survival_model(…)
survivalstan.utils.plot_stan_summary([fit1],metric='rhat')
survivalstan.utils.plot_coefs([fit1])
功能
--
-各种标准生存模型
-weibull,指数型,γ参数化
-各种半参数和非参数基线危害
-支持时变系数
-估计时变影响
-按组变化影响
-可扩展框架-带上自己的斯坦码,或编辑提供的模型
-使用熊猫<;https://pandas.pydata.org>;``data frames&;`patsy<;https://pypi.python.org/pypi/patsy>;``公式
-图形后验预测检查
-使用'seaborn<;https://pypi.python.org/pypi/seaborn>;``后验估计绘制关键参数估计的后验图,如'pandas<;http://pandas.pydata.org>;``数据帧
-支持通过`stancache<;http://github.com/jburos/stancache>;``或`pystan cache<;https://github.com/paulkernfeld/pystan cache>;进行缓存;`
安装
----
有任何问题或疑问,请通知我们。
请提交问题“github<;http://github.com/hammerlab/survivalstan/issues>;”,或通过“gitter<;https://gitter.im/survivalstan>;`
许可证
---
该项目是在apache 2.0许可证下获得许可的。
documentation
---
https org lt gt github http 模型库 survival stan
Sphinx Quickstart于2017年1月6日06:25:53创建。
您可以完全根据自己的喜好调整此文件,但它至少应包含根“toctree”指令。
survivalstan是用“stan<”编写的生存模型库;http://mc stan.org>;``它还包含许多实用函数,在进行生存分析时非常有用。
典型用法:
:
准备数据
fit1=survival stan.fit_stan_survival_model(…)
survivalstan.utils.plot_stan_summary([fit1],metric='rhat')
survivalstan.utils.plot_coefs([fit1])
功能
--
-各种标准生存模型
-weibull,指数型,γ参数化
-各种半参数和非参数基线危害
-支持时变系数
-估计时变影响
-按组变化影响
-可扩展框架-带上自己的斯坦码,或编辑提供的模型
-使用熊猫<;https://pandas.pydata.org>;``data frames&;`patsy<;https://pypi.python.org/pypi/patsy>;``公式
-图形后验预测检查
-使用'seaborn<;https://pypi.python.org/pypi/seaborn>;``后验估计绘制关键参数估计的后验图,如'pandas<;http://pandas.pydata.org>;``数据帧
-支持通过`stancache<;http://github.com/jburos/stancache>;``或`pystan cache<;https://github.com/paulkernfeld/pystan cache>;进行缓存;`
安装
----
有任何问题或疑问,请通知我们。
请提交问题“github<;http://github.com/hammerlab/survivalstan/issues>;”,或通过“gitter<;https://gitter.im/survivalstan>;`
许可证
---
该项目是在apache 2.0许可证下获得许可的。
documentation
---
标签: