脚本脚本(sos):用于可重复数据分析的交互式、跨平台和跨语言工作流系统

sos-notebook的Python项目详细描述


涉及多个脚本的复杂生物信息数据分析工作流 在不同的语言中,很难合并、共享和复制。 一个简化整个数据收集、分析的环境, 这种多语言分析的可视化和报告过程是 目前缺乏。

我们开发了脚本(SoS)笔记本,一个交互式数据分析 不同脚本语言的数据在其中自由流动的环境 语言内部和跨语言。SoS笔记本具有多语言笔记本 接口、跨语言变量交换协议、预览引擎 可视化变量和常见的生物信息文件格式,以及 报表生成工具,用于从 语言。SOS笔记本使研究人员能够执行复杂的 使用最适合的工具进行生物信息分析 工作流,不受特定语言或 跨语言交流的复杂性。

有关SOS的详细信息,请参阅http://vatlab.github.io/SOS/

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