solvebio python客户端
solvebio的Python项目详细描述
solvebio python客户端
这是solvebio python包和命令行界面(cli)。 这个模块已经在Python2.6+、Python3.1+和Pypy上进行了测试。
此版本的python客户端与基于vault的数据集兼容 仅限(2017年7月28日发布)。
开发人员文档可在docs.solvebio.com找到。有关solvebio的更多信息,请访问www.solvebio.com。
安装和设置
使用pip
:
solvebio
pip install solvebio
对于交互使用,我们建议安装IPython
和gnureadline
:
pip install ipython
pip install gnureadline
要登录,请键入:
solvebio login
输入你的solvebio证书,你应该很好去!
自动安装程序(仅限python 2.x)
注意:以下安装程序仅适用于Python2.x。
打开终端并粘贴以下命令:
curl -skL install.solvebio.com/python | bash
从git安装
pip install -e git+https://github.com/solvebio/solvebio-python.git#egg=solve
开发
git clone https://github.com/solvebio/solvebio-python.git
cd solve-python/
python setup.py develop
要运行测试,请使用nosetest
:
nosetests solvebio.test.test_dataset
或者安装tox
并运行:
pip install tox
tox
释放
维护人员可以通过以下步骤将solvebio python发布到pypi:
# Bump the version and update the changelog
bumpversion <major|minor|patch>
git push --tags
github_changelog_generator
# Build and release to PyPI
find . -name '*.pyc' -delete
rm -rf dist/*
python setup.py clean
python setup.py sdist bdist_wheel
twine upload dist/*
您需要configure Twine才能推送到pypi。
支架
开发人员文档可在docs.solvebio.com找到。
如果您遇到这个包的问题,请create a GitHub Issue。
对于所有其他请求,请email SolveBio Support。