Python模块来读取Cameca（nano）SIMS数据文件。
sims的Python项目详细描述
模拟人生
Python模块来读取Cameca（nano）SIMS数据文件。在
亮点
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从Cameca SIMS或nanomims文件中读入数据，使数据可以在Python科学堆栈（numpy/pandas/xarray/matplotlib）中直接访问。在
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读入文件的complete头。获取实验时记录的机器的每个设置。据我所知，没有其他软件能做到这一点。在
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读取几乎每个Cameca软件可以生成的文件。除了常见的数据文件（.im图像文件和.is'同位素'或spot文件），该软件还生成许多其他文件。举几个例子：
- 高质量分辨率扫描（.hmr）
- 二次离子束定心扫描（.sib）
- 脉冲高度分布扫描（.phd）
- E0S定心扫描（.E0S）
- 能量扫描（.nrj）
- 光束稳定性记录（.bs）
- 还有更多！在
其中大多数都可以被sims模块读取。尽可能增加对更多文件的支持。据我所知，没有其他软件能做到这一点。在
在 - 在
直接从compressed文件读取数据。尤其是.im图像文件往往会占用大量空间，即使大多数数据是零。它们可以压缩到原来大小的90%。sims支持直接读取用gzip、bzip2、xz、lzma、7zip和zip压缩的文件。您还可以使用tar、zip或7zip将多个文件合并到一个多文件归档中，然后直接从中读取部分或全部文件。在
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它是开源和免费的，允许您确切地看到计算和数据转换是如何完成的。这与其他封闭源代码的程序形成了鲜明的对比，在这些程序中，你只需相信那些程序的编写者正确地实现了一切。你看不到他们是怎么做到的，因为他们不让你看到代码的内部。这个程序是完全开放的！看看事情是怎么做的，如果你不喜欢，就改进吧！在
在
新增功能
v2.0.0
由于0.25版pandas不再支持4DPanel和Panel。西姆斯已经改为使用xarray，这是推荐的 多维数据的数据结构。Xarray在很大程度上是基于pandas的，访问数据的语法几乎完全相同。有关详细信息，请参见xarray。在
sims的2.0版本也放弃了对Python2.x的支持，现在需要Python3.4或更高版本。在
v1.0.0
这个版本支持Python2.7并使用pandas作为数据结构。如果需要支持，请使用此版本。在
安装
安装此Python模块的要求：
- Python 3.4或更新版本
- 沙雷
- 神经质的
- scikit图像
- matplotlib库
要安装，只需从命令行运行：
$ pip install sims
入门
一旦安装了sims，就可以开始使用nanomims文件了。在
^{pr2}$# Show the header[13]:s.header...# too big to show here# Show a small portion of the header[14]:s.header['BFields'][0]{'b field enabled':True,'b field bits':856507,'wait time':0.0,'time per pixel':0.0075,'time per step':20.0,'wait time computed':False,'E0W offset':-13,'Q':389,'LF4':1601,'hex val':575,'frames per bfield':1,'Trolleys':[{'label':'12C','mass':12.004397767933469,'radius':442.47767499881127,'deflection plate 1':-68,'deflection plate 2':67,'detector':'EM','exit slit':268850,'real trolley':True,'cameca trolley index':0,'peakcenter index':1,'peakcenter follow':1,'focus':0.0,'hmr start':-16.996336996336996,'start dac plate 1':-68,'start dac plate 2':67,'hmr step':4,'hmr points':50,'hmr count time':0.54,'used for baseline':False,'50% width':95.616,'peakcenter side':'both','peakcenter count time':0.54,'used for sib center':False,'unit correction':0,'deflection':-9.963369963369964,'used for energy center':False,'used for E0S center':False,'trolley enabled':True,'used for phd scan':False,'phd start':3995,'phd step size':-30,'phd points':30,'phd count time':0.54,'phd scan repeat':3,'trolley label':'Trolley 1','detector label':'Detector 1'},...# Skipped all the other trolleys],'counting frame time':491.52,'scanning frame time':491.52,'working frame time':491.52}# Export header to JSON (text) format[19]:sims.utils.export_header(s,filename='header.txt')
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