用于单细胞适应性免疫受体库（AIRR）分析的Python库
scirp的Python项目详细描述
Scirpy是一个可伸缩的python工具包，用于分析T细胞受体（TCR）或B细胞受体（BCR） 来自单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的曲目。它与流行的 scanpy库和 提供数据导入、分析和可视化的各种模块。在
安装
您需要在系统上安装Python3.6或更新版本。如果你没有 Python已安装，建议安装Miniconda。在
安装scirpy有几种备选方案：
- 从PyPI安装最新版本的scirpy：
pip install scirpy
- 从Bioconda获取：
- 安装最新的开发版本：
pip install git+https://github.com/icbi-lab/scirpy.git@master
docker pull quay.io/biocontainers/scirpy:<tag>
其中tag是these tags之一。在
支持
我们很乐意在使用scirpy时帮助解决问题。请报告任何错误， 使用issue tracker的功能请求或帮助请求。 我们试图在两个工作日内做出回应，不管是修复错误还是实现新功能 可能需要更长的时间，这取决于我们开发人员的可用性。在
发行说明
参见release section。在
联系人
请使用issue tracker。在
引文
Sturm, G. Tamas, GS, …, Finotello, F. (2020). Scirpy: A Scanpy extension for analyzing single-cell T-cell receptor sequencing data. Bioinformatics. doi:10.1093/bioinformatics/btaa611
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