用于科学应用的简单工作流平台,最初是在电子显微镜图像处理的Scipion框架内开发的。

scipion-pyworkflow的Python项目详细描述


Contributor Covenant

pyworkflow

pyworkflow是一个用于科学应用的简单工作流平台。它已经初步开发出来了 在电子显微镜图像处理的Scipion框架内。在

pyworkflow允许您通过定义以下一组类来定义工作域:

  • Objects: input/outputs that will be generated by different programs
  • Protocols: special type of Objects that have defined input parameters and will produce some output
  • Viewers: Entities that provide graphical analysis of results.
  • Wizards: Small GUIs that can be develop to help users to select given parameter values.

开发

我们现在正朝着Python3迈进!在

为了开发目的安装pyworkflow,可以执行以下操作:

# Create a clean virtual environment
python -m venv ~/myenv
source ~/myenv/bin/activate
git clone git@github.com:scipion-em/scipion-pyworkflow.git
cd scipion-pyworkflow
python -m pip install -e .  # Install in the environment as development

运行测试

首先确保pyworkflow作为Python模块在 当前Python环境。在开发过程中,我倾向于设置PYTHONPATH:

^{pr2}$

安装

使用python虚拟环境时,您可能需要: #对于ubuntu中的virtual env: #sudo apt get安装python3 dev #sudo apt get安装python3 tk

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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