在Scipion框架中使用SIDESPLITTER程序的插件
scipion-em-sidesplitter的Python项目详细描述
这个插件为SIDESPLITTER程序提供了包装,以减轻局部过度拟合。在
prod: | devel: |
安装
您需要使用Scipion的3.0版本才能运行这些协议。要安装插件,有两个选项:
- 稳定版本
scipion installp -p scipion-em-sidesplitter
开发人员版本
在- download repository
git clone https://github.com/scipion-em/scipion-em-sidesplitter.git
- install
scipion installp -p path_to_scipion-em-sidesplitter --devel
SIDESPLITTER源代码将随插件自动安装,但您也可以链接现有安装。在
- Default installation path assumed is ^{tt1}$, if you want to change it, set SIDESPLITTER_HOME in ^{tt2}$ file pointing to the folder where the SIDESPLITTER is installed.
要检查安装,只需运行以下Scipion测试之一:
^{pr2}$执行scipion test --show--grep sidesplitter
支持的版本
1.2条
协议
- 局部滤波器
参考文献
- Kailash Ramlaul,Colin M.Palmer和Christopher H.S.Aylett(2020年)。用侧裂器消除单粒子重建中的局部过拟合。https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2019.12.12.874081v2
- 项目
标签: