生物信息学的数据结构、算法和教育资源。
scikit-bio的Python项目详细描述
scikit bio是一个开源的、bsd许可的python 3包，为生物信息学提供数据结构、算法和教育资源。
要查看scikit bio的文档，请访问scikit-bio.org。
注意：scikit bio不再与python 2兼容。scikit bio与python 3.4及更高版本兼容。
Scikit Bio目前处于测试阶段。我们正在非常积极地开发它，并且向后不兼容的接口更改可以也将出现。为了避免这些类型的更改给我们的用户带来意外，我们对公共api进行了修饰，以便让用户清楚何时可以依赖（稳定的）api，何时可以进行更改（实验性的）。请参阅API stability docs了解更多详细信息，包括我们在本文中所说的stable和experimental的含义。
安装
建议通过Anaconda或miniconda中提供的condapackage manager安装scikit bio。
要安装最新版本的scikit bio:
conda install -c conda-forge scikit-bio
或者，可以使用pip：
安装scikit biopip install numpy pip install scikit-bio
您可以通过运行scikit bio单元测试来验证您的安装：
python -m skbio.test
对于debian的用户，skbio在debian软件发行版中，可以 安装时使用：
sudo apt-get install python3-skbio python-skbio-doc
获取帮助
要获得scikit bio的帮助，应该在stackoverflow（so）上使用skbio标记。在发布问题之前，请查看so关于如何ask a question的指南。scikit bio开发人员定期监视skbioso标记。
使用scikit bio的项目
我们知道的一些使用scikit bio的项目是：
如果您在自己的项目中使用scikit bio，可以发出pull请求将它们添加到此列表中。
许可
scikit bio在新的bsd许可下可用。见 COPYING.txt获取scikit bio的许可证，以及 licenses directory用于 （部分或全部）与Scikit Bio一起分发。
scikit bio的前史
scikit bio源于PyCogent和QIIME的代码，并且 贡献者和/或版权所有者已同意制定本规范 他们在BSD下为Pycogent和/或Qime写作 执照。pycogent和/或qiime模块的贡献者 被移植到Scikit Bio的有：Rob Knight（@rob-knight）、Gavin Huttley（@gavin-huttley）、Daniel McDonald（@wasade）、Micha Hamady、Antonio Gonzalez （@antgonza），桑德拉·斯密特，格雷格 卡波拉索（@gregcaporaso），贾伊 ram rideout（@jairideout）， 凯西·洛祖蓬（cathy lozupone），迈克·罗伯森（mike robeson） （@mikerobeson），马辛·西斯利克， 彼得·麦克斯韦尔、杰里米·威德曼、刘宗智、迈克尔·德万、洛根·克奈特 （@loganknecht），安德鲁·科克伦， 何塞·卡洛斯·克莱门特（@cleme），达米恩 科伊，莱维·麦克拉肯，安德鲁·巴特菲尔德，威尔·范特雷伦（@wdwvt1），贾斯汀·库钦斯基（@justin212k），何塞·安东尼奥·纳瓦斯·莫利纳 （@josenavas），马修·韦克菲尔德 （@genomematt）和Jens Reeder （@jensreeder）。
徽标
scikit bio的徽标是由Alina Prassas创建的。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
