sbmlsim是模拟SBML的工具。
sbmlsim的Python项目详细描述
sbmlsim:SBML模拟变得容易
sbmlsim是python实用程序的集合,用于模拟以简化模拟 SBML模型在 roadrunner。源代码可从 https://github.com/matthiaskoenig/sbmlsim。在
功能包括
- 模拟实验
- 模拟报告
- 参数拟合
文档可在https://sbmlsim.readthedocs.io上找到。 如果您有任何问题或问题,请open an issue。在
许可证
- 源代码:LGPLv3
- 文档:CC BY-SA 4.0
sbmlsim源代码在GPL和LGPL许可证版本2或 以后再说。您可以选择使用该软件的许可证。在
这个程序是自由软件:你可以重新发布和/或修改它 GNU通用公共许可证或GNU通用公共许可证的条款 由自由软件基金会发布的许可证 许可证,或(由您选择)任何更高版本。在
但在这个程序中,它是有用的吗 保证;甚至连适销性或适用性的默示保证都没有 特殊目的。有关更多详细信息,请参阅GNU通用公共许可证。在
资金
Matthias König得到了联邦教育和研究部(BMBF,德国)的支持 在肝脏医学研究网络系统中(LiSyM,批准号031L0054)。在
安装
sbmlsim可从pypi和 可通过以下方式安装:
pip install sbmlsim
要求
可通过linux安装HDF5支持:
^{pr2}$开发版本
最新开发版本可通过以下方式安装:
pip install git+https://github.com/matthiaskoenig/sbmlsim.git@develop
或者通过克隆存储库并通过以下方式安装:
git clone https://github.com/matthiaskoenig/sbmlsim.git cd sbmlsim pip install -e .
安装以供开发使用:
pip install -e .[development]
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