RNAlysis 1.1.0

rna分析-c.elegansrna测序数据分析

这是什么？

rnalysis是一个python包，为来自c.elegans的rna测序数据提供模块化分析管道。 该软件包包括各种过滤方法、数据可视化、聚类分析、富集分析和 探索性分析。

rnanalysis允许您按任何顺序执行过滤和分析。 它有能力在任何给定阶段保存或加载进度， 并记录在保存的文件名中执行的操作顺序。

rnanalysis处理来自python的htseq的htcount文件和来自r的deseq2的deseq文件。

• 文档：https://guyteichman.github.io/RNAlysis

主要特点

• 按计数、生物类型、变化方向、重要性等筛选deseq和htcount文件。
• htcount文件的规范化
• 勘探图
• go、组织和表型富集分析
• 自定义特征特性的丰富分析

依赖性

• 努比
• 熊猫
• matplotlib
• 肖伯恩
• 组织富集分析
• 统计模型
• sklearn

哪里可以买到

在python提示符下使用以下命令：

pip install RNAlysis

学分

这个包是用Cookiecutter和audreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。

历史记录

0.1.0（2019-06-20）

• pypi上的第一个版本。