resdk 11.0.1

文档和帮助

阅读documentation中的详细说明。

安装

从pypi安装：

pip install resdk

如果您使用macos，请注意连接到所需的Python shipped with the system doesn’t support TLSv1.2版本 任何genialis.com服务器（可能还有其他服务器）。为了解决这个问题， 安装最新版本的python 3.6+via official installer from Python.org或with Homebrew。

如果您想为sdk代码库做出贡献，请按照 installation steps for developers。

快速启动

在这个展示中，我们将下载对齐读取和 来自服务器的索引（BAM和BAI）：

importresdk# Create a Resolwe object to interact with the serverres=resdk.Resolwe(url='https://app.genialis.com')# Enable verbose logging to standard outputresdk.start_logging()# Get sample meta-data from the serversample=res.sample.get('resdk-example')# Download files associated with the samplesample.download()

两个文件（bam和bai）都已下载到工作目录。 看看他们。要了解有关resolwe sdk的更多信息，请继续 Getting started。

如果您没有访问resolwe服务器的权限，请通过以下地址与我们联系 info@genialis.com。